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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000304`

染色体: Chr06 坐标: 2186340-2189357 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000304`
名称	SmilChr06G000304
描述	uncharacterized SmilChr06G000304
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2186340 - 2189357 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987844`
GeneID	`130987844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987844`
原始查询	`LOC130987844`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827919]; symbol=AT4G02540; hit=AT4G02540; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827919]; symbol=AT4G02540; hit=AT4G02540; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G02540` (AT4G02540) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827919] identity=26.3; qcov=0.863; evalue=2.18e-37; confidence=low
Rice	`Os09g0492800` - identity=31.4; qcov=0.18; evalue=3.5e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767525.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767525.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767525.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767525.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2186508`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr6:2186508`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr6:2186559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B16,B55,B88,C43
`Chr6:2186583`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	78	A11,A15,A2,A22,A23,A25,A6,B101,B103,B105,B108,B109,B115,B120,B121,B126,B13,B131,B132,B133,B134,B16,B17,B20,B24,B33,B34,B36,B4,B40,B42,B43,B45,B46,B47,B56,B60,B63,B65,B69,B7,B72,B74,B75,B77,B78,B80,B82,B90,B95,B96,B99,C2,C20,C23,C25,C27,C3,C32,C39,C40,C41,C42,C51,C54,C56,C6,C60,C70,C71,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C85,D10
`Chr6:2186588`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	77	A11,A15,A2,A22,A23,A25,A6,B101,B103,B105,B108,B109,B115,B120,B121,B126,B13,B131,B132,B133,B134,B16,B20,B24,B33,B34,B36,B4,B40,B42,B43,B45,B46,B47,B56,B60,B63,B65,B69,B7,B72,B74,B75,B77,B78,B80,B82,B90,B95,B96,B99,C2,C20,C23,C25,C27,C3,C32,C39,C40,C41,C42,C51,C54,C56,C6,C60,C70,C71,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C85,D10
`Chr6:2186596`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A11,A2,A22,A23,A25,A6,B101,B103,B108,B109,B120,B121,B126,B13,B131,B132,B133,B134,B16,B17,B33,B34,B36,B4,B42,B43,B45,B46,B56,B60,B65,B69,B7,B72,B74,B75,B77,B78,B80,B82,B90,B95,B96,C2,C20,C23,C25,C27,C3,C32,C41,C42,C51,C54,C56,C6,C60,C71,C75,C77,C8,C81,C85,D10
`Chr6:2186599`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	61	A11,A2,A22,A23,A25,A6,B101,B103,B108,B109,B120,B121,B126,B13,B132,B133,B134,B16,B17,B34,B36,B4,B42,B43,B45,B46,B56,B60,B65,B69,B7,B72,B74,B75,B77,B78,B82,B90,B95,B96,C2,C20,C23,C25,C27,C3,C32,C40,C42,C51,C54,C56,C6,C60,C71,C75,C77,C8,C81,C85,D10
`Chr6:2186662`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B136,B55,B88
`Chr6:2186662`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B136,B55,B88
`Chr6:2186688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B122,B31,B79
`Chr6:2186710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,A23
`Chr6:2186711`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A19,A9,B107,B133,B17,B82,B93,C29,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767525.1

656 aa

328

656

C1_2

PF03107 C1_2 18-72 aa PF03107 C1_2 81-131 aa PF03107 C1_2 149-192 aa PF03107 C1_2 205-254 aa PF03107 C1_2 418-462 aa PF03107 C1_2 531-579 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767525.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	18	72	5.4e-56	187.4	C1 domain
`XP_057767525.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	81	131	5.4e-56	187.4	C1 domain
`XP_057767525.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	149	192	5.4e-56	187.4	C1 domain
`XP_057767525.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	205	254	5.4e-56	187.4	C1 domain
`XP_057767525.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	418	462	5.4e-56	187.4	C1 domain
`XP_057767525.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	531	579	5.4e-56	187.4	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911542.1
GGAAAATACACATTGAATGCTGTATATATAGTATTGTCTTTTGGAGAGTGATTAGTGATAAATAGAGGGAGGAAAAAAGAATGTTGAGAGAGAAAGAAAGAGAAATGGAGAAGGAGAGTTTTCCTCATGTGCTTCATAAACACCCGCTGAGCCTGATCCCCAATCCCGCCGCAGAAACTGATAATTCTTGGTTCACTTGGTGTTATGGTTGTTGGAGATACTTTTTACCAGGAGATGCAGCCTATGGATGCAGCCAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987844
ATGTTGAGAGAGAAAGAAAGAGAAATGGAGAAGGAGAGTTTTCCTCATGTGCTTCATAAACACCCGCTGAGCCTGATCCCCAATCCCGCCGCAGAAACTGATAATTCTTGGTTCACTTGGTGTTATGGTTGTTGGAGATACTTTTTACCAGGAGATGCAGCCTATGGATGCAGCCAAAGGTGTAGATTTGATCTGGTATTACACAAAGAATGCATGGAAATGCCGAGAGAGATTCGTCATCCTCTCCATCCTTCACACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767525.1
MLREKEREMEKESFPHVLHKHPLSLIPNPAAETDNSWFTWCYGCWRYFLPGDAAYGCSQRCRFDLVLHKECMEMPREIRHPLHPSHSLTLTLQQPLYVATRSCAVCEVSLRYGQLFYKCSGGCEWWIHLRCTGDFDAAVVDDVPTMKHPSHPQHQLRFSKKTISCCDACGASHKGNSYICTICDYWIHESCALLLVSAHFPHHRPDHSLSLAFNPPYEYLRYEFVCAICSGTLPMRRWVYHCQLCRYVVHINCATNTSSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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