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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000314`

染色体: Chr06 坐标: 2270788-2274760 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000314`
名称	SmilChr06G000314
描述	uncharacterized SmilChr06G000314
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2270788 - 2274760 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987849`
GeneID	`130987849`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987849`
原始查询	`LOC130987849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821664]; symbol=AT3G21120; hit=AT3G21120; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821664]; symbol=AT3G21120; hit=AT3G21120; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G21120` (AT3G21120) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821664] identity=27.1; qcov=0.419; evalue=2.12e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987849

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767535.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767535.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767535.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767535.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2273125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B3,B78,C29,C62
`Chr6:2273150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B46,C42,C78
`Chr6:2273163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B82,C73
`Chr6:2273185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C80
`Chr6:2273216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B4,B58,B63
`Chr6:2273248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr6:2273336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr6:2273337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:2273344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:2273364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:2273413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:2273494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B45,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767535.1

406 aa

203

406

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 13-219 aa PF07734 FBA_1 47-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767535.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	13	219	2.1e-07	31.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767535.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	47	201	2.3e-16	60.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911552.1
CAAACACGCCGCCCTCCCCTCCCTCTCTCCTCCCGCCTTCTCTCGAATCGGCGGCTCTCAGGGTCACAGGAGCTCTAGCCCTAGTAGACGTTCAACAAGCCGAGCCGACTCGACTCTAGAGTAACAAGAAAGCATTCGCCGAATTTGGTTGTCTTGAAACGTGCTAAGCTTTGATTCTAGAGTATAAGAAAGAATGGATGAGTTTGTTTTGAACGGTGGTGGCGATAAGCATTATTTATCTGTTATTTCTCCCCAAGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987849
ATGGATGAGTTTGTTTTGAACGGTGGTGGCGATAAGCATTATTTATCTGTTATTTCTCCCCAAGACATGTCTCCCAAGGAAGGATGTGAAAACATCAATCTTTCCATTTATGATGATGATGAGGTTTATGGAGGAATTTGTGGTGGGCTGTTGTATTTGGATAATTTTGAAGGCAAAATTGCTCTTTGCAACTTAACCAATAAAGAGTTCAAATTTCTTCCTCCTCCCAAGAAATCCGAGAATTCCAGTCCATATCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767535.1
MDEFVLNGGGDKHYLSVISPQDMSPKEGCENINLSIYDDDEVYGGICGGLLYLDNFEGKIALCNLTNKEFKFLPPPKKSENSSPYLDIFSISGLGYDSKSGDYKLIRKYERWYSRVEVDERFGRPIYNCYGCTKTELYSLASDSWKEIPNRDVDLELCGVYVGGSCYWQVLGGEGQSFAVMSFNFTDESFSCLPSLPLSMGDNVIDIVECRGYVGAIAYDRPIGYEQPKESGSVCNSFHCKPFQLWVCKERLWTKTFSVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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