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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000310`

染色体: Chr06 坐标: 2235088-2238621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000310`
名称	SmilChr06G000310
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 21, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2235088 - 2238621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987853`
GeneID	`130987853`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987853`
原始查询	`LOC130987853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 21, chloroplastic-like
产物	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 21%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G07480` (KUOX1) KAR-UP oxidoreductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830640] identity=45.2; qcov=0.925; evalue=1.31e-69; confidence=high
Rice	`Os04g0667400` (OsSTA135) - identity=43.3; qcov=0.85; evalue=4.33e-64; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987853

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767540.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767541.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767540.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767540.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2236520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B86,B94
`Chr6:2236608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B63,B83,B99,C30
`Chr6:2236865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr6:2238134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:2238267`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B57,B87,C48,D9
`Chr6:2238267`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B57,B87,C48,D9
`Chr6:2238376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:2238425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B45,C21,C73
`Chr6:2238466`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B101,B109,B118,B33,B40,B82,C20,C39,C6,C77,C8,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767540.1

309 aa

154

309

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 11-105 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 163-258 aa

XP_057767541.1

280 aa

140

280

2OG-FeII_Oxy

PF03171 2OG-FeII_Oxy 134-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767540.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	11	105	3.6e-18	67.0	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057767540.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	163	258	9.4e-22	78.0	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily
`XP_057767541.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	134	229	1.5e-21	77.3	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911557.1
GGAAAGAGATTTCTATTTTGGGAAAACCATTATCCTTTCCACTCCACCGATGACCGATCTATTTTACGGTTTTCACTAAAGTCCTAATTTTGCCCCCAAATTTGCCTTCAATCGGCAGCTCCTACTCATCCTCCCCTTTCAGTTGCTCCGTCGTGTCGCGTTGCGTCGCTGCCGTTGATTGTAAAGATTCCTTGTGTGCGAGAAGAAAGGCGAGCTTCTCCGAGCACACTGCGAATCCAAGCATATGGATGAGCATTTGG...

XM_057911558.1
GGAAAGAGATTTCTATTTTGGGAAAACCATTATCCTTTCCACTCCACCGATGACCGATCTATTTTACGGTTTTCACTAAAGTCCTAATTTTGCCCCCAAATTTGCCTTCAATCGGCAGCTCCTACTCATCCTCCCCTTTCAGTTGCTCCGTCGTGTCGCGTTGCGTCGCTGCCGTTGATTGTAAAGATTCCTTGTGTGCGAGAAGAAAGGCGAGCTTCTCCGAGCACACTGCGAATCCAAGCATATGGATGAGCATTTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987853
ATGGATGAGCATTTGGAAACCTTGACGGATGTGCCGACAATCAATCTTTCTCTACTACATCAAGATCCTCAGAGCAGATTTGTGGTTATCAAGAAAATTCGTGAAGCTTGCCACACATATGGACTTTTCAATGTTATTAATCACGGGATACATGATTCAGTGATAGAAGATGCTTTAAATGTGAATGCCAGATTCTTTGAGATGCCATTAGCAGAAAAAGAGGAGCTCTTTTCAGATGATGTGCGGAAACCAGTGAGATT...

LOC130987853
ATGTGCCGACAATCAATCTTTCTCTACTACATCAAGATCCTCAGAGCAGATTTGTGGTTATCAAGAAAATTCGTGAAGCTTGCCACACATATGGACTTTTCAATATTCTTTGAGATGCCATTAGCAGAAAAAGAGGAGCTCTTTTCAGATGATGTGCGGAAACCAGTGAGATTTCAGCATGTAAATCGTGGAGATTATTCAAAGGATTTCCTCAAGCTCTATGCCCATCCACTTGAACACTTCATCTCATATTGGCCAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767540.1
MDEHLETLTDVPTINLSLLHQDPQSRFVVIKKIREACHTYGLFNVINHGIHDSVIEDALNVNARFFEMPLAEKEELFSDDVRKPVRFQHVNRGDYSKDFLKLYAHPLEHFISYWPSFPPDYREKMGIYSTEVRKLCIELFGAIMESLSLDQTHLKQEFKQGFQILGVNCYNRCTESSTKNGTPPHTDHSVITLLLQSAPGLDFMDPEGSWKSIPKLKGSLQVFVGDHLEVISNGFYKSVLHRAINSSNGAARVSIASLHS...

XP_057767541.1
MCRQSIFLYYIKILRADLWLSRKFVKLATHMDFSIFFEMPLAEKEELFSDDVRKPVRFQHVNRGDYSKDFLKLYAHPLEHFISYWPSFPPDYREKMGIYSTEVRKLCIELFGAIMESLSLDQTHLKQEFKQGFQILGVNCYNRCTESSTKNGTPPHTDHSVITLLLQSAPGLDFMDPEGSWKSIPKLKGSLQVFVGDHLEVISNGFYKSVLHRAINSSNGAARVSIASLHSLGMDEIVEPAAELERDENTRRYRGSSLRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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