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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002878`

染色体: Chr01 坐标: 47381106-47389482 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002878`
名称	SmilChr01G002878
描述	oligouridylate-binding protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47381106 - 47389482 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987854`
GeneID	`130987854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987854`
原始查询	`LOC130987854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oligouridylate-binding protein 1-like
产物	oligouridylate-binding protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G17370` (UBP1B) oligouridylate binding protein 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838309] identity=74.2; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0615400` (P0616D06.127-1) - identity=71; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767545.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057767545.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057767545.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057767545.1`
5	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057767545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47382714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47382721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:47384746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B79,D1
`Chr1:47385031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B79,D1
`Chr1:47388420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:47388435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:47388499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,C8
`Chr1:47389141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C58,D5
`Chr1:47389162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B39,B5,B73,D9
`Chr1:47389166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B39,B5,B73,D9
`Chr1:47389181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B101,C58
`Chr1:47389181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767545.1

407 aa

204

407

RRM_1

PF00076 RRM_1 53-119 aa PF00076 RRM_1 138-208 aa PF00076 RRM_1 259-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767545.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	53	119	7e-49	164.3	RNA recognition motif
`XP_057767545.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	138	208	7e-49	164.3	RNA recognition motif
`XP_057767545.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	259	325	7e-49	164.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911562.1
TAGTGTAGTTGCACGCACATCATCATCATCTCATTCTTCTCCCCCTCTCTCTGCGAGGGTTCTTTTTCTTTTCTTTTCCTTTTTTCTTCTCCCTTTCATTTCTCTCAATTTTTAATTCTTTTCCGCTTCTGGTCACCCCGATTTTTCTATTCCCATTTTTATTTCCCTTCTTTCTCCCGTTTATATATTTTTCTGCTGTTTGTACGGAAAAAAAGAAGGGATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGTTGAAGCAGCAACAGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987854
ATGCAGCAGCAGCAGCAAAGGTTGAAGCAGCAACAGCAGCAGCTAGCGCTGATGCAGCAGTCCCTTTACCATCCGGGTCTTCTCGCTCCTCCTCAGATAGAACCTATCTTGAGTGGGAATTTGCCTCCTGGATTTGACTCAAGCTCATGCCGCAGTGTGTACGTTGGAAATATCCACCCTCAAGTTACTGAACCTCTTCTTCAGGAGGTTTTCTCAGGTACAGGTCCTCTTGAAGGTTGCAAGCTCATTCGGAAAGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767545.1
MQQQQQRLKQQQQQLALMQQSLYHPGLLAPPQIEPILSGNLPPGFDSSSCRSVYVGNIHPQVTEPLLQEVFSGTGPLEGCKLIRKEKSSYGFVDYFDRRSAALAIVTLNGRHLFGQPIKVNWAYASAQREDTSNHFNIFVGDLSPEVTDATLFACFSVYPTCSDARVMWDQKTGRSRGFGFVSFRSQQDAQSSINDLNGKWLGSRQIRCNWAAKGAGQGDEQQNPDSKNVVELTNGASDDGQEKRNEDAPENNPQYTTVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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