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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000299`

染色体: Chr06 坐标: 2128271-2130258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000299`
名称	SmilChr06G000299
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2128271 - 2130258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987859`
GeneID	`130987859`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987859`
原始查询	`LOC130987859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT3G10400` (U11/U12-31K) RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820203] identity=60.4; qcov=1.02; evalue=1.43e-79; confidence=high
Rice	`Os09g0549500` - identity=62.4; qcov=1.04; evalue=9.11e-89; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767547.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057767547.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767547.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057767547.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2128541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr6:2128550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B104,B75,B90
`Chr6:2128566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr6:2128576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr6:2128580`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B50,B59,B65,B86,C1,C25,C45,C78
`Chr6:2128584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:2128596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:2128625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr6:2128637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B27,B65,B90
`Chr6:2128664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C40
`Chr6:2128668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A19,C35
`Chr6:2128733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C14,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767547.1

255 aa

128

255

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 52-122 aa PF00098 zf-CCHC 146-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767547.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	52	122	1.2e-19	70.7	RNA recognition motif
`XP_057767547.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	146	161	9.1e-06	26.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911564.1
AAAATAAAAATAAAATTATAAAATACTAAAGAATCCCTAGACTTTCGATCAGAACCGCCGCGCCGCTCATCGAGATTTCTCCTCTTAAGTCTTCAGAGCCGCCACTCTTCTTTTTCTCCTCGAAGCTTCTTCTTCTTCATCATTACGGTAAAAGAAAAGATGCCTCGGAAGAGAAACCAGAGCGACGACGAAGAGGACGATACCTTCTTCTACCGCTACTCCTCCGCCGCCGCCGAGGCGACGCCGTCCACCGGCGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987859
ATGCCTCGGAAGAGAAACCAGAGCGACGACGAAGAGGACGATACCTTCTTCTACCGCTACTCCTCCGCCGCCGCCGAGGCGACGCCGTCCACCGGCGCATCCAAATCCTCGCGCGGCGGCGGAAGCGGAGGGCTGGCGCCGTCGAAATCGACGGTGTACGTCAGCAACATCGACTACAACCTGACCAACTCCGACCTCCACACGATCTTCTCCACCTTCGGCAAGCTCGCCAAGGTCACGGTGCTCAAGGACCGCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767547.1
MPRKRNQSDDEEDDTFFYRYSSAAAEATPSTGASKSSRGGGSGGLAPSKSTVYVSNIDYNLTNSDLHTIFSTFGKLAKVTVLKDRATRQSKGVAFVLFVRREDAARAAKEMDGKILNGRTLRASIAADNGRATEFIKKKVYKDKSRCYECGEEGHLSYECPRNFLGPRERPPPPKKGRRGGSGGGESRGRDFEGGEEEEREDEGELEMENWASVVDGGGAAEERLLKVEDGKGGVRKERREKKKGYFSDESDDED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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