当前解析结果
SmilChr06G000323| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000323 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000323 |
| 描述 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 2365039 - 2367614 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987865 |
|---|---|
| GeneID | 130987865 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987865 |
| 原始查询 | LOC130987865 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM8-like |
| 产物 | mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM8-like |
| Arabidopsis | AT5G50810 (TIM8)translocase inner membrane subunit 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835153] identity=67.6; qcov=0.974; evalue=2.59e-30; confidence=medium |
| Rice | Os08g0535600- identity=59.4; qcov=0.908; evalue=2.61e-30; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02953 (zf-Tim10_DDP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987865 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057767554.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057767554.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057767554.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767554.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767554.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:2365261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,B86 |
Chr6:2365402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr6:2367370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767554.1PF02953
zf-Tim10_DDP 14-76 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767554.1 |
Pfam | PF02953 |
zf-Tim10_DDP | Domain | 14 | 76 | 5.1e-26 | 90.7 | Tim10/DDP family zinc finger |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。