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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000332`

染色体: Chr06 坐标: 2482031-2484034 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000332`
名称	SmilChr06G000332
描述	uncharacterized SmilChr06G000332
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2482031 - 2484034 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987879`
GeneID	`130987879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987879`
原始查询	`LOC130987879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0194700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0194700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G29540` (RPC14) RNApolymerase 14 kDa subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817503] identity=66.7; qcov=0.886; evalue=2.61e-44; confidence=medium
Rice	`Os12g0194700` - identity=67; qcov=0.981; evalue=3.55e-50; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01193 (RNA_pol_L); PF13656 (RNA_pol_L_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767563.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767563.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057767563.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767563.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2483070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:2483128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B103,C1,C8
`Chr6:2483356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B3
`Chr6:2483390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C83
`Chr6:2483684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B46,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767563.1

105 aa

105

RNA_pol_L_2

RNA_pol_L

PF13656 RNA_pol_L_2 12-83 aa PF01193 RNA_pol_L 13-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767563.1`	Pfam	`PF13656`	RNA_pol_L_2	Domain	12	83	2.4e-28	98.3	RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain
`XP_057767563.1`	Pfam	`PF01193`	RNA_pol_L	Domain	13	75	1.9e-10	41.0	RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911580.1
TTTCATTGGCTCAAATAGGATTGAAGTAATTCTTCTAGAAGTTATAAACTATTTGAGGCGCTGCTGCTTCCGCCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTGCTGCTGTTCTATCACACATTTGTCGAAATTGAGTTCTCAGCCTAGTGTGTTGACTTCCTAGACGTGCAAAAAGTGTCATGGAGCACGGGTCGATCCAGGATCAATCTCAAGCAACATTCTCGTTGACAGACGAAGACCACACTCTAGCAAACTCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987879
ATGGAGCACGGGTCGATCCAGGATCAATCTCAAGCAACATTCTCGTTGACAGACGAAGACCACACTCTAGCAAACTCAGTTAGATATATTCTTAATCAAGACCCAAGAGTAACATTTTGCGGTTACAGCATACCACACCCTTCCGATGCTCGGGTGAACATCAGAGTGCAGACTACTGGCGACCCAGCTCGCGAGGTATTGAAGGATTCGTGCCAGGATCTAATGCTCGTATGCAAGCATGTCACGAGCACCTTTGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767563.1
MEHGSIQDQSQATFSLTDEDHTLANSVRYILNQDPRVTFCGYSIPHPSDARVNIRVQTTGDPAREVLKDSCQDLMLVCKHVTSTFDQAVMEFKSKQGIESMNITP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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