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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000343`

染色体: Chr06 坐标: 2578972-2584901 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000343`
名称	SmilChr06G000343
描述	uncharacterized SmilChr06G000343
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2578972 - 2584901 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987890`
GeneID	`130987890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987890`
原始查询	`LOC130987890`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0509400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0509400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41110` (AT5G41110) meiosis chromosome segregation family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834113] identity=40.1; qcov=0.882; evalue=5.67e-110; confidence=medium
Rice	`Os09g0509400` - identity=37.3; qcov=1.09; evalue=1.15e-116; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13889 (Chromosome_seg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767575.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767575.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767575.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767575.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767575.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2580587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C16
`Chr6:2580630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,D10
`Chr6:2580644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B129,B14
`Chr6:2580814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,D1
`Chr6:2580821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B118,B2,C63
`Chr6:2581004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A8,B103,C1,C51
`Chr6:2581005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A8,B103,C1,C51
`Chr6:2581118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A8,B103,C1,C51
`Chr6:2581233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C43
`Chr6:2581662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B123,B57,C86,D4
`Chr6:2581776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:2581824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767575.1

701 aa

350

701

Chromosome_seg

PF13889 Chromosome_seg 617-699 aa

XP_057767576.1

701 aa

350

701

Chromosome_seg

PF13889 Chromosome_seg 617-699 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767575.1`	Pfam	`PF13889`	Chromosome_seg	Family	617	699	1.3e-23	83.6	Chromosome segregation during meiosis
`XP_057767576.1`	Pfam	`PF13889`	Chromosome_seg	Family	617	699	1.3e-23	83.6	Chromosome segregation during meiosis

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911592.1
GTTAATAGATAGATATATATCCAAAGGGTATGTGCTATAGATTGAAGAAGAAGAAGATAGTATATTTTTACCCGAATAGATTTATTTCTATACAAAGGAGAGAAACAGATAGAAACGCGAGGCGCCGCTGCACAATTTAGTATTATTGCAAGATTCACTGCATTCTTTTCGTTTACTTTCCCAAATATAAAACCCTTTAGCTTAATCCAATCAAAATTTTCGTGATTTCCGATAGTTTGTAATCTGAACTGGATAGGTTG...

XM_057911593.1
AGATATATATCCAAAGGGTATGTGCTATAGATTGAAGAAGAAGAAGATAGTATATTTTTACCCGAATAGATTTATTTCTATACAAAGGAGAGAAACAGATAGAAACGCGAGGCGCCGCTGCACAATTTAGTATTATTGCAAGATTCACTGCATTCTTTTCGTTTACTTTCCCAAATATAAAACCCTTTAGCTTAATCCAATCAAAATTTTCGTGATTTCCGATAGTTTGTAATCTGAACTGGTTGTGATCTTGCCGAGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987890
ATGGGCTTGCCTCAAGTTCCATCAGGAAGTGTAGCTGATGAAGTGTCAACAACGGTGAGCTCAATGATGCAGATACCCACACGGTTTGGTGCTGCAGGAAGCTTTGGTGTGAGCGAGAGGCACATTAGACAGTCGAACAGTCGCATAACTGATGACTTTCCGTGCTCTTCGTTTGGGGAACGTGCAAAGGAATGTGGTACGGTTAGCTTGCATCAAGATGGTGTTCCCAATCTGCAAAAATTGAGGATTGAATCTATAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767575.1
MGLPQVPSGSVADEVSTTVSSMMQIPTRFGAAGSFGVSERHIRQSNSRITDDFPCSSFGERAKECGTVSLHQDGVPNLQKLRIESIDKTSFLSRHGGKNIQTPASRIVGFEPNGLINCANQYEDKQPDSIHLSCGNSMTCNTSENSSSMVRKRLLSPLNGMVLPDGFRGERLEIGNTSYLEDFHLRGGSYGITLKENKKAHIGNLDHGSPPNWSIPIFSRSSSPSEEDCDVNCRIITDGPLFENHGCVSQNLLSSYSGLT...

XP_057767576.1
MGLPQVPSGSVADEVSTTVSSMMQIPTRFGAAGSFGVSERHIRQSNSRITDDFPCSSFGERAKECGTVSLHQDGVPNLQKLRIESIDKTSFLSRHGGKNIQTPASRIVGFEPNGLINCANQYEDKQPDSIHLSCGNSMTCNTSENSSSMVRKRLLSPLNGMVLPDGFRGERLEIGNTSYLEDFHLRGGSYGITLKENKKAHIGNLDHGSPPNWSIPIFSRSSSPSEEDCDVNCRIITDGPLFENHGCVSQNLLSSYSGLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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