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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000391`

染色体: Chr06 坐标: 3123050-3125503 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000391`
名称	SmilChr06G000391
描述	zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3123050 - 3125503 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987938`
GeneID	`130987938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987938`
原始查询	`LOC130987938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5-like
产物	zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5-like
Arabidopsis	`AT2G01940` (SGR5) C2H2-like zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814725] identity=54.6; qcov=1.03; evalue=1.34e-143; confidence=high
Rice	`Os09g0449400` (OsIDD13) - identity=52.6; qcov=1.16; evalue=1.97e-149; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2); PF22995 (C2CH-3rd_BIRD-IDD); PF22996 (C2H2-2nd_BIRD-IDD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767635.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767635.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767635.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767635.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3123384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:3123401`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A8
`Chr6:3123401`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A8
`Chr6:3123552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B126,B30,C59
`Chr6:3123588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B41,B89,C3
`Chr6:3123597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:3123615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C81
`Chr6:3123804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C16,C47
`Chr6:3123846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C16
`Chr6:3123876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B108,B22,D10,D4
`Chr6:3123994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B72
`Chr6:3124715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767635.1

402 aa

201

402

zf-C2H2

C2H2-2nd_BIRD-IDD

C2CH-3rd_BIRD-IDD

PF00096 zf-C2H2 44-66 aa PF22996 C2H2-2nd_BIRD-IDD 81-115 aa PF22995 C2CH-3rd_BIRD-IDD 120-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767635.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	44	66	2.9e-06	28.1	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057767635.1`	Pfam	`PF22996`	C2H2-2nd_BIRD-IDD	Family	81	115	5.3e-19	68.7	BIRD-IDD transcription factor, second C2H2 zinc finger
`XP_057767635.1`	Pfam	`PF22995`	C2CH-3rd_BIRD-IDD	Domain	120	144	3.9e-14	52.7	BIRD-IDD transcription factor, third C2HC zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911652.1
TCACAATTATGACTGTGTTTTTGTTCCTTTATGGGGATGTTTTTCTTCATATCAACTTTCAACCATATATTGTCATTGGCCCCTAAACCCCCCCCCACCTATACCCCACCCCCCCCCCCCCCACCCCACCCCCTACCCCCATCATCATCTTTTCAACAAGTTTATTTAGGCAGCCTTTCATATATAACTATACCTGAGGAAGATGTTTCTTGAGAGAGAAAAACTTTGTATCTCATTTACATTTATTTTGGAAAAGTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987938
ATGCTGAGCAACATTGATCCGTCCGCCGAGTACGCGGCGAGCAAGCGGAAGCGGCGGCCGGCGGGGACGCCAGATCCGGACGCGGAGGTGGTGTCGCTGTCGCCGAAGACGCTGCTGGAGTCGGATCGGTACGTGTGCGAGATCTGCAACCAAGGGTTCCAGCGGGATCAGAACCTGCAGATGCACCGGCGCCGGCACAAGGTGCCGTGGAAGCTGCTGAAGAGGGAGACGCCGGTGGCGCGTAAGCGCGTGTTCGTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767635.1
MLSNIDPSAEYAASKRKRRPAGTPDPDAEVVSLSPKTLLESDRYVCEICNQGFQRDQNLQMHRRRHKVPWKLLKRETPVARKRVFVCPEPSCLHHDPCHALGDLVGIKKHFRRKHSNQKQWVCDKCSKGYAVQSDYKAHLKTCGTRGHSCDCGRVFSRVESFIEHQDACSMGRLRSDALPPPACLSRTASSPSPSSDTNLSVVAPWQAAAAALAKPSNEAIFVTASTCPPNLELQLLTKSNEDHSTQLQLSIGSSEINGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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