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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000396`

染色体: Chr06 坐标: 3161647-3168363 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000396`
名称	SmilChr06G000396
描述	putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3161647 - 3168363 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987944`
GeneID	`130987944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987944`
原始查询	`LOC130987944`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase
产物	putative 3%2C4-dihydroxy-2-butanone kinase
Arabidopsis	`AT3G17770` (AT3G17770) Dihydroxyacetone kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821045] identity=80.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0719300` (B1377B10.5) - identity=77; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004371 (glycerone kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0019563 (glycerol catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF02733 (Dak1); PF02734 (Dak2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767641.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767641.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767641.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767641.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3161942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C11,C69
`Chr6:3161978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C3
`Chr6:3162167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B14,B82
`Chr6:3162535`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr6:3162535`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr6:3164651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B55,C2,C78
`Chr6:3166263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr6:3168154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767641.1

593 aa

296

593

Dak1

Dak2

PF02733 Dak1 22-339 aa PF02734 Dak2 407-582 aa

XP_057767642.1

592 aa

296

592

Dak1

Dak2

PF02733 Dak1 22-339 aa PF02734 Dak2 407-581 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767641.1`	Pfam	`PF02733`	Dak1	Family	22	339	1.3e-115	386.3	Dak1 domain
`XP_057767641.1`	Pfam	`PF02734`	Dak2	Family	407	582	4.3e-42	144.7	DAK2 domain
`XP_057767642.1`	Pfam	`PF02733`	Dak1	Family	22	339	1.3e-115	386.3	Dak1 domain
`XP_057767642.1`	Pfam	`PF02734`	Dak2	Family	407	581	2.2e-42	145.6	DAK2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911659.1
TATTTATTTAATTTCTTGTTCGGACAAGCAAAATGCATTAAAATCAACAACTATTCAACAGTCAGGGATTGCTAATTGGACTGTGCGCACGCATTTACCCATGGATTTTCACAGCAAGAAACTCATTAATGACCCAAACGACGTCGTGACAGAGTTCATTGAGGGTCTGGTTGAAACCTATCCTGGGTTGCAGTATTTGGATGGTTTCCCTGATGTAAAAGTTGTATTACGTGCTGATGTTTCTGGTGCCACTTATGACA...

XM_057911658.1
ATTTATTTAATTTCTTGTTCGGACAAGCAAAATGCATTAAAATCAACAACTATTCAACAGTCAGGGATTGCTAATTGGACTGTGCGCACGCATTTACCCATGGATTTTCACAGCAAGAAACTCATTAATGACCCAAACGACGTCGTGACAGAGTTCATTGAGGGTCTGGTTGAAACCTATCCTGGGTTGCAGTATTTGGATGGTTTCCCTGATGTAAAAGTTGTATTACGTGCTGATGTTTCTGGTGCCACTTATGACAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987944
ATGGATTTTCACAGCAAGAAACTCATTAATGACCCAAACGACGTCGTGACAGAGTTCATTGAGGGTCTGGTTGAAACCTATCCTGGGTTGCAGTATTTGGATGGTTTCCCTGATGTAAAAGTTGTATTACGTGCTGATGTTTCTGGTGCCACTTATGACAAAGTAGCCGTAATATCAGGAGGTGGAAGTGGTCATGAGCCTGCTCATGCTGGATTTGTTGGAGAGGGGATGCTTACTGCAGCAATCTGTGGGGATGTTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767641.1
MDFHSKKLINDPNDVVTEFIEGLVETYPGLQYLDGFPDVKVVLRADVSGATYDKVAVISGGGSGHEPAHAGFVGEGMLTAAICGDVFASPPVDSILAGIRAVTGPSGCLLIVKNYTGDRLNFGLAAEQAKSEGYKVEMVIVGDDCALPPPRGIAGRRGLAGTILVHKIAGAAAASGLSLEEVAAEAKRASDMVGTMGVALSVCTLPGQVTPDRLGPGKMELGLGIHGEPGAAVADLQPVDIVVSHVLKQILSAETNYVPI...

XP_057767642.1
MDFHSKKLINDPNDVVTEFIEGLVETYPGLQYLDGFPDVKVVLRADVSGATYDKVAVISGGGSGHEPAHAGFVGEGMLTAAICGDVFASPPVDSILAGIRAVTGPSGCLLIVKNYTGDRLNFGLAAEQAKSEGYKVEMVIVGDDCALPPPRGIAGRRGLAGTILVHKIAGAAAASGLSLEEVAAEAKRASDMVGTMGVALSVCTLPGQVTPDRLGPGKMELGLGIHGEPGAAVADLQPVDIVVSHVLKQILSAETNYVPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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