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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000401`

染色体: Chr06 坐标: 3234166-3241676 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000401`
名称	SmilChr06G000401
描述	uncharacterized SmilChr06G000401
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3234166 - 3241676 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987950`
GeneID	`130987950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987950`
原始查询	`LOC130987950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821051]; symbol=AT3G17830; hit=AT3G17830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821051]; symbol=AT3G17830; hit=AT3G17830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17830` (AT3G17830) Molecular chaperone Hsp40/DnaJ family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821051] identity=50; qcov=0.866; evalue=2.15e-155; confidence=high
Rice	`Os02g0804500` (OsDjA2) - identity=47.4; qcov=0.752; evalue=9.97e-132; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009408 (response to heat); GO:0031072 (heat shock protein binding); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF00684 (DnaJ_CXXCXGXG); PF01556 (DnaJ_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767647.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057767647.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057767647.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767647.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3234634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B72,C5
`Chr6:3234656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:3234657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B33
`Chr6:3234692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B68,D1,D2
`Chr6:3234693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3236018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3236030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:3236179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C60,C78
`Chr6:3236186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,C79
`Chr6:3237149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B52,B97,C46
`Chr6:3238329`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr6:3238329`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767647.1

536 aa

268

536

DnaJ

DnaJ_C

DnaJ_CXXCXGXG

PF00226 DnaJ 67-128 aa PF01556 DnaJ_C 189-407 aa PF00684 DnaJ_CXXCXGXG 216-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767647.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	67	128	3e-26	92.0	DnaJ domain
`XP_057767647.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	189	407	1.5e-36	126.5	DnaJ C terminal domain
`XP_057767647.1`	Pfam	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	Domain	216	280	1.7e-13	51.3	DnaJ central domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911664.1
TTAAGTCCAAGAGAAAACACCCCATTGTTTACCTCAACTTGAACCGAAACCCTTAATTCCCAATTGCAATCTCTCACAAAGCCATGCAATTATCCCCAAACCCCAATTTGCGATCCATCAATTCAAACTTCATCTTCTGCAGTTCGAGCTGCAAGTTCGAGAATTTGGGATTCTCGGCCACAGTTTTCCCATCCTTCAAGCTAAGAGTTCCCCATTCGATTAATTTCAGTGGCACCAGACGTCGCCGTTTTGCTCCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987950
ATGCAATTATCCCCAAACCCCAATTTGCGATCCATCAATTCAAACTTCATCTTCTGCAGTTCGAGCTGCAAGTTCGAGAATTTGGGATTCTCGGCCACAGTTTTCCCATCCTTCAAGCTAAGAGTTCCCCATTCGATTAATTTCAGTGGCACCAGACGTCGCCGTTTTGCTCCCGCCGCCCAAAAAGTCTCCGGTCCTGACTACTATTCCGTTCTCAATGTCAGTAGAAATGCCAATCTGCAAGAAATTAAAGCCGCTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767647.1
MQLSPNPNLRSINSNFIFCSSSCKFENLGFSATVFPSFKLRVPHSINFSGTRRRRFAPAAQKVSGPDYYSVLNVSRNANLQEIKAAYRSLARRYHPDMNKGPGAEEKFKEIAAAYEILSDTQKRSVYDRFGEEGLRGEFDATRAGPQGVDPFEVFAEYFGDPSNFFGGSGEQSGFNFNFRENSSQNLDIRCDLYLSFEESIFGGKRDVEVPYFKTCDDCGGTGAKSSNCLKTCSECGGRGRIMKTEKTPFGVMSQVTSCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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