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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000405`

染色体: Chr06 坐标: 3290895-3308856 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000405`
名称	SmilChr06G000405
描述	stromal processing peptidase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3290895 - 3308856 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987956`
GeneID	`130987956`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987956`
原始查询	`LOC130987956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stromal processing peptidase, chloroplastic
产物	stromal processing peptidase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G42390` (SPP) Insulinase (Peptidase family M16) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834245] identity=76.6; qcov=0.925; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0625400` (SPP) - identity=73.3; qcov=0.902; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00675 (Peptidase_M16); PF05193 (Peptidase_M16_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987956

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767662.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057767662.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057767662.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057767662.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3291128`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr6:3291128`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr6:3291132`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A13
`Chr6:3291132`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A13
`Chr6:3291150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B43,B86,C13
`Chr6:3291152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B43,B86,C13
`Chr6:3291159`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C58
`Chr6:3291159`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C58
`Chr6:3291177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B42,B43,B50,C54
`Chr6:3291182`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	106	A13,A2,A21,A23,A25,A5,A7,A8,B1,B10,B100,B104,B106,B109,B11,B112,B113,B114,B120,B122,B124,B125,B126,B128,B129,B131,B133,B136,B140,B16,B17,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B3,B30,B34,B35,B38,B39,B41,B42,B43,B46,B48,B49,B51,B53,B54,B59,B66,B70,B74,B75,B76,B79,B81,B82,B86,B88,B89,B91,B97,B99,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C21,C23,C27,C28,C3,C34,C35,C36,C4,C41,C47,C48,C6,C60,C64,C65,C69,C75,C76,C79,C80,C81,C84,C86,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7
`Chr6:3296065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr6:3296303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767662.1

1260 aa

630

1260

Peptidase_M16

Peptidase_M16_C

PF00675 Peptidase_M16 203-323 aa PF05193 Peptidase_M16_C 355-592 aa PF05193 Peptidase_M16_C 924-1151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767662.1`	Pfam	`PF00675`	Peptidase_M16	Family	203	323	1.2e-21	77.8	Insulinase (Peptidase family M16)
`XP_057767662.1`	Pfam	`PF05193`	Peptidase_M16_C	Domain	355	592	8.3e-41	140.5	Peptidase M16 inactive domain
`XP_057767662.1`	Pfam	`PF05193`	Peptidase_M16_C	Domain	924	1151	8.3e-41	140.5	Peptidase M16 inactive domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911679.1
GCTCATTTACGTACAAGCAATTTTCGTTTTCCCAAAACAATTTCTTCTTCTCCAATTCTCTAATTATCTTCAACTCCATCCATTCACATATCTTTGATTCTCCCTAATTTCGCAATTATGCAGAGCTCAGCTATCGTATTCAACACTAAACCAATTTTAGCCTCGATTCATACCAGCACTAGCTGTAACCATAGTAAAGAAAGCTCTAATTCTGCTCTGTTTCCAGCCAAATTTAATCGGACACGGTTAAAGAAGGCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987956
ATGCAGAGCTCAGCTATCGTATTCAACACTAAACCAATTTTAGCCTCGATTCATACCAGCACTAGCTGTAACCATAGTAAAGAAAGCTCTAATTCTGCTCTGTTTCCAGCCAAATTTAATCGGACACGGTTAAAGAAGGCCATTACCTTGCGGCCGCCGCAGAACGGTTGTCGCAGCCGCTTGTGTTCCGTTAGCAGTAAGACAAGTAGAAGACTTTGTTCCGAGTTCAAAGAATTATCACCTCATTCACGTTTGCTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767662.1
MQSSAIVFNTKPILASIHTSTSCNHSKESSNSALFPAKFNRTRLKKAITLRPPQNGCRSRLCSVSSKTSRRLCSEFKELSPHSRLLANSQRVSCFHSYNRKKIGVKRFTSGFFADKSTFHLTKSLPDNAEARKIQVPHASVGPEEPHAASTTWPDGVTEKSGLDIVDTEAERLEFENFLRFEIPSHPKLHRGQLKNGLRYLILPNKVPNNRFEAHMEVHVGSIDEEDDEQGIAHMIEHVAFLGSKKREKLLGTGARSNAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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