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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000407`

染色体: Chr06 坐标: 3326864-3329310 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000407`
名称	SmilChr06G000407
描述	glutamine synthetase nodule isozyme-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3326864 - 3329310 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987957`
GeneID	`130987957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987957`
原始查询	`LOC130987957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamine synthetase nodule isozyme-like
产物	glutamine synthetase nodule isozyme-like
Arabidopsis	`AT5G37600` (GSR 1) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833738] identity=88.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0735200` (OsGS1) - identity=89; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004356 (glutamine synthetase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006542 (GO:0006542)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00120 (Gln-synt_C); PF03951 (Gln-synt_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767663.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057767663.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767663.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767663.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3327026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B33,B46,C62
`Chr6:3327077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B138,B88,C49,C57
`Chr6:3327370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B49,B79,C46,C78
`Chr6:3327410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B3,B98,C49,C9
`Chr6:3328771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,D11
`Chr6:3328783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B23,C12,C6,C80
`Chr6:3328792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C60,C7,D4,D7
`Chr6:3328972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C44
`Chr6:3329159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767663.1

356 aa

178

356

Gln-synt_N

Gln-synt_C

PF03951 Gln-synt_N 48-97 aa PF00120 Gln-synt_C 110-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767663.1`	Pfam	`PF03951`	Gln-synt_N	Domain	48	97	5.8e-10	39.4	Glutamine synthetase, beta-Grasp domain
`XP_057767663.1`	Pfam	`PF00120`	Gln-synt_C	Domain	110	255	2.2e-16	60.6	Glutamine synthetase, catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911680.1
CTATATATACATACTAGCAAGAGGAGTGTGATATTTACAAAGCAAAGCAACTTCTCATTAATTTTGATTATTTTCAGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGTGCAAAAAATGGCTCTGCTCAACGATCTCACCAACTTGAATCTCTCCGACTCTACTGACAAAATCATAGCAGAATATATATGGATTGGAGGAAGTGGGCTAGATCTCCGAAGCAAGGCCAGGACACTGACGGGACCCGTTCGCGATCCGTCGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987957
ATGGCTCTGCTCAACGATCTCACCAACTTGAATCTCTCCGACTCTACTGACAAAATCATAGCAGAATATATATGGATTGGAGGAAGTGGGCTAGATCTCCGAAGCAAGGCCAGGACACTGACGGGACCCGTTCGCGATCCGTCGGAATTGCCAAAATGGAATTTCGACGGATCCAGCACCGGCCAGGCGCCGGGGGAAGACTCTGAAGTCATCATCTATCCTCAGGCAATTTTCCCTGATCCTTTCAGGAGAGGAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767663.1
MALLNDLTNLNLSDSTDKIIAEYIWIGGSGLDLRSKARTLTGPVRDPSELPKWNFDGSSTGQAPGEDSEVIIYPQAIFPDPFRRGNNILVMCDAYTPAGEPIPTNKRHNAAKIFSHADVVAEEPWYGIEQEYTLLQKEVKWPLGWPAGGFPGPQGPYYCGIGADKAYGRDIVDSHYKACLYAGINISGINAEVMPAQWEFQVGPSVGISAADQVWVARYILERITEIAGVVVSFDPKPIPGDWNGAGAHTNYSTKSMRGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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