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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002891`

染色体: Chr01 坐标: 47591308-47599619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002891`
名称	SmilChr01G002891
描述	uncharacterized SmilChr01G002891
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47591308 - 47599619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987961`
GeneID	`130987961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987961`
原始查询	`LOC130987961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745580]; symbol=AT2G34357; hit=AT2G34357; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745580]; symbol=AT2G34357; hit=AT2G34357; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G34357` (AT2G34357) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745580] identity=52.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0782100` - identity=48.6; qcov=0.899; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08161 (RRP12_HEAT); PF25772 (HEAT_RRP12_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767673.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057767673.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767673.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767673.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767673.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47591718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:47591726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:47591733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B13,B140
`Chr1:47591734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47591835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:47591950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:47591980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B40
`Chr1:47592343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C43
`Chr1:47592739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C43
`Chr1:47593247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:47593499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:47594603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767673.1

1281 aa

640

1281

HEAT_RRP12_N

RRP12_HEAT

PF25772 HEAT_RRP12_N 6-275 aa PF08161 RRP12_HEAT 341-645 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767673.1`	Pfam	`PF25772`	HEAT_RRP12_N	Repeat	6	275	4e-92	309.1	RRP12-like, N-terminal HEAT repeats
`XP_057767673.1`	Pfam	`PF08161`	RRP12_HEAT	Repeat	341	645	8e-79	265.8	Ribosomal RNA-processing protein 12, HEAT repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911690.1
TTAAACCAATCAGCAAGAACCCTAAAACCCCCCGTCGCCAACCTCAATCCCTCTCTTCATTCCAGGCGACATGGAGGCGTCGCCGCCAGATTTCTCCGAGGACTTCTCCTCCGCCGTGCTCTCCCAGTTCAGCAACTCCACCAACGAGCACCACCTTCACGTCTGCGCTACCATCGGCGCCATGTCGCAGGAACTCCGGGAGAAACGCCTCCCCCTCACCCCCATCACTTACTTCGGCGCCACCTGCTCCTCTCTCGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987961
ATGGAGGCGTCGCCGCCAGATTTCTCCGAGGACTTCTCCTCCGCCGTGCTCTCCCAGTTCAGCAACTCCACCAACGAGCACCACCTTCACGTCTGCGCTACCATCGGCGCCATGTCGCAGGAACTCCGGGAGAAACGCCTCCCCCTCACCCCCATCACTTACTTCGGCGCCACCTGCTCCTCTCTCGACCGCCTCTCGTCGAGCACCGACTCCTCCGCGTCTATCCTCGACTCCCTGCTCACGATTCTGTCCCTCGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767673.1
MEASPPDFSEDFSSAVLSQFSNSTNEHHLHVCATIGAMSQELREKRLPLTPITYFGATCSSLDRLSSSTDSSASILDSLLTILSLVVVRLPPAVLTSKYSYLSELLIKILGVKSVGAEGVVPGLNCVSRLLILREKAAWEDVAELYGVLIGYITEDRFKVRKRSHSCLRDVLKYFQLVPTLSHLLASASEAITNVFVRFLLLAGGSNESISEASGTARNVLRILDALKICLPYMSSKSTSNILERFRSLLTLKQRVVTIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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