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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000414`

染色体: Chr06 坐标: 3403863-3409700 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000414`
名称	SmilChr06G000414
描述	auxin response factor 2B-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3403863 - 3409700 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987964`
GeneID	`130987964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987964`
原始查询	`LOC130987964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 2B-like
产物	auxin response factor 2B-like
Arabidopsis	`AT5G62000` (ARF2) auxin response factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836321] identity=61.3; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0479400` (OsARF24) - identity=54.1; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA); PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767678.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767678.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767678.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767678.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3405883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,C17,C21,C78
`Chr6:3406068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B64,D3
`Chr6:3406149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B93
`Chr6:3406195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B64,D3
`Chr6:3406266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:3406343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3406624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:3406723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:3406786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:3408026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B35,B82,C85,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767678.1

835 aa

418

835

ARF_AD

AUX_IAA

PF02362 B3 143-244 aa PF06507 ARF_AD 292-373 aa PF02309 AUX_IAA 702-803 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767678.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	143	244	9.8e-23	80.7	B3 DNA binding domain
`XP_057767678.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	292	373	4.3e-36	123.4	Auxin response factor ancillary domain
`XP_057767678.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	702	803	5e-13	50.1	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089893.1
AAAAAGTTAAATACTGTGGCTGGAAACAACACCCGTTTTCATCGCTCTGGTTGTCTTGAAGCCCATGACCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTTTCTCTCTCATCAACTATTAGCTAACAGTGCATCCCACACCTTTTAAGCTCCCCATGCTTCAAGATATCCTCACTACAACCTCCACACACACACTCACAAACTCCACTGAAAATATCTTATACACAAATTCCGTTTATAATCCTGACCTCTAGCGTAGAATT...

XM_057911695.1
AAAAAGTTAAATACTGTGGCTGGAAACAACACCCGTTTTCATCGCTCTGGTTGTCTTGAAGCCCATGACCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTTTCTCTCTCATCAACTATTAGCTAACAGTGCATCCCACACCTTTTAAGCTCCCCATGCTTCAAGATATCCTCACTACAACCTCCACACACACACTCACAAACTCCACTGAAAATATCTTATACACAAATTCCGTTTATAATCCTGACCTCTAGCGTAGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987964
ATGGATGCTTCTGAGGTCTTGATCAAAGGGTATAACGACGTCGGCGGAGGCGATCCCGTGCCGGGGAACAGGAATTCCGAGGCCGGGAGAGTGGATGCTGAGAGAGCGTTGTACACAGAGCTGTGGAAGGCGTGCGCCGGCCCACTGGTGACGGTGCCGCGCGAGAATGAGCTTGTTTTCTACTTTCCACAGGGTCACATAGAACAGGTCGAGGCATCGACTAATCAGAGCTCTGACCAGCAGATGCCAGTGTACAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767678.1
MDASEVLIKGYNDVGGGDPVPGNRNSEAGRVDAERALYTELWKACAGPLVTVPRENELVFYFPQGHIEQVEASTNQSSDQQMPVYNLPPKILCRVVNVQLKAEADTDEVFAQITLMPETNQDENAERKEPPPLPPPHFRVYSFCKTLTASDTSTHGGFSVLRRHADECLPPLDMSRQPPTQELVAKDLHGNEWRFRHIFRGQPRRHLLQSGWSVFVSSKRLVAGDAFIFLRGENGELRAGVRRAMRQQGNVPSSVISSHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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