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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000418`

染色体: Chr06 坐标: 3472685-3474994 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000418`
名称	SmilChr06G000418
描述	uncharacterized SmilChr06G000418
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3472685 - 3474994 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987969`
GeneID	`130987969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987969`
原始查询	`LOC130987969`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767687.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767687.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767687.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767687.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3473233`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A22,A25,A5,B1,B100,B108,B109,B112,B114,B117,B124,B126,B136,B14,B140,B15,B24,B36,B5,B50,B51,B55,B66,B7,B72,B75,B76,B80,B95,C16,C24,C25,C33,C36,C5,C51,C52,C53,C60,C74,C76,C77,C79,D3
`Chr6:3473245`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A22,A25,A5,B1,B100,B108,B109,B112,B114,B117,B124,B126,B136,B14,B140,B15,B24,B36,B5,B50,B51,B55,B66,B7,B72,B75,B76,B80,B95,C15,C16,C23,C24,C25,C26,C33,C36,C5,C51,C52,C53,C60,C74,C76,C77,C79,D3
`Chr6:3473248`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A22,A25,A5,B1,B100,B108,B109,B112,B114,B117,B124,B126,B136,B14,B140,B15,B24,B36,B5,B50,B51,B55,B66,B7,B72,B75,B76,B80,B95,C15,C16,C23,C24,C25,C33,C36,C5,C51,C52,C53,C60,C74,C76,C77,C79,D3
`Chr6:3473249`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C87
`Chr6:3473249`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C87
`Chr6:3473264`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	57	A18,A2,A3,A7,B101,B102,B105,B106,B108,B109,B11,B112,B114,B125,B140,B21,B23,B25,B34,B40,B41,B45,B47,B56,B59,B60,B65,B70,B81,B89,B9,B93,B96,B99,C10,C12,C3,C34,C36,C4,C43,C48,C50,C51,C6,C61,C72,C73,C74,C80,C81,C87,D1,D11,D2,D8,D9
`Chr6:3473371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:3473376`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A18,A2,A3,A7,B101,B102,B105,B106,B108,B109,B11,B112,B114,B125,B140,B21,B23,B25,B34,B40,B41,B45,B47,B56,B59,B60,B65,B70,B81,B89,B9,B93,B96,B99,C10,C12,C13,C3,C34,C36,C4,C43,C48,C50,C51,C6,C61,C72,C73,C74,C80,C81,C87,D1,D11,D2,D8,D9
`Chr6:3473378`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A18,A2,A3,A7,B102,B105,B106,B11,B125,B21,B23,B25,B34,B40,B41,B45,B47,B56,B59,B60,B65,B70,B81,B89,B9,B93,B96,B99,C10,C12,C13,C3,C34,C4,C43,C48,C50,C6,C61,C72,C73,C80,C81,C87,D1,D11,D2,D8,D9
`Chr6:3473380`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A2,A3,A7,B102,B105,B106,B108,B109,B11,B112,B114,B125,B140,B21,B23,B34,B40,B41,B45,B47,B56,B59,B60,B65,B70,B81,B89,B9,B93,B96,C10,C3,C34,C36,C4,C43,C48,C50,C51,C6,C72,C73,C74,C80,C81,C87,D1,D11,D2,D8,D9
`Chr6:3473383`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr6:3473383`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767687.1

407 aa

204

407

FBA_1

FBA_3

PF07734 FBA_1 133-348 aa PF08268 FBA_3 140-346 aa

XP_057767688.1

407 aa

204

407

FBA_1

FBA_3

PF07734 FBA_1 133-348 aa PF08268 FBA_3 140-346 aa

XP_057767689.1

407 aa

204

407

FBA_1

FBA_3

PF07734 FBA_1 133-348 aa PF08268 FBA_3 140-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767687.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	133	348	2.7e-11	43.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767687.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	140	346	6.5e-16	58.9	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767688.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	133	348	2.7e-11	43.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767688.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	140	346	6.5e-16	58.9	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767689.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	133	348	2.7e-11	43.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767689.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	140	346	6.5e-16	58.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911706.1
TTAAGCCCATTTTAAAACTCAAGAGCCCATACACAATTTACCCACAGAAAGCGCATGGCTTCACTCCTCGCCGCCTCCGCCGCCAGGCGCCGCTTCCCGATACTCATGTCTTTCTACGCCCGTCTTAGCTCCACCACGTGCTACTTTGAGCGCAGAGAGGGAGAGGGGGAGAAAGAACGAAGGTCGGAAGATGAGAATTTGGATAAGAAAATCTTGGATGCTTACAGAACTCTTCGAATTCGAGGTTATAATGAGTCGGA...

XM_057911705.1
TTAAGCCCATTTTAAAACTCAAGAGCCCATACACAATTTACCCACAGAAAGCGCATGGCTTCACTCCTCGCCGCCTCCGCCGCCAGGCGCCGCTTCCCGATACTCATGTCTTTCTACGCCCGTCTTAGCTCCACCACGTGCTACTTTGAGCGCAGAGAGGGAGAGGGGGAGAAAGAACGAAGGTCGGAAGATGAGAATTTGGATAAGAAAATCTTGGATGCTTACAGAACTCTTCGAATTCGAGGTTATAATGAGTCGGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987969
ATGGCTTCACTCCTCGCCGCCTCCGCCGCCAGGCGCCGCTTCCCGATACTCATGTCTTTCTACGCCCGTCTTAGCTCCACCACGTGCTACTTTGAGCGCAGAGAGGGAGAGGGGGAGAAAGAACGAAGGTCGGAAGATGAGAATTTGGATAAGAAAATCTTGGATGCTTACAGAACTCTTCGAATTCGAGGTTATAATGAGTCGGAGATAAAATCTGTGTCTCAACCTTTGACTGTGACTGCTGAGGCCCCAGATATATC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767687.1
MASLLAASAARRRFPILMSFYARLSSTTCYFERREGEGEKERRSEDENLDKKILDAYRTLRIRGYNESEIKSVSQPLTVTAEAPDISPKPQTADIFVPSTDRDGCRYFRAYSVDEEDGSLSPKYYVYPPSPQKWSYHGATCNGVFHLMNGDWEQILWNPTTEECKTLPMPFVRRSYSREAFVRDELMVSGMWYDHTRENYKLLQLIKSNALVMARRTNYVWHSIWLYSLESDSWKEMPPTHLITVCNDTSACINDVFYCA...

XP_057767688.1
MASLLAASAARRRFPILMSFYARLSSTTCYFERREGEGEKERRSEDENLDKKILDAYRTLRIRGYNESEIKSVSQPLTVTAEAPDISPKPQTADIFVPSTDRDGCRYFRAYSVDEEDGSLSPKYYVYPPSPQKWSYHGATCNGVFHLMNGDWEQILWNPTTEECKTLPMPFVRRSYSREAFVRDELMVSGMWYDHTRENYKLLQLIKSNALVMARRTNYVWHSIWLYSLESDSWKEMPPTHLITVCNDTSACINDVFYCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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