当前解析结果
SmilChr06G000426| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000426 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000426 |
| 描述 | trihelix transcription factor ASR3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 3503165 - 3504648 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987977 |
|---|---|
| GeneID | 130987977 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987977 |
| 原始查询 | LOC130987977 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | trihelix transcription factor ASR3-like |
| 产物 | trihelix transcription factor ASR3-like |
| Arabidopsis | AT2G33550 (AT2G33550)Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817920] identity=34.2; qcov=1.09; evalue=1.58e-20; confidence=low |
| Rice | Os02g0516800- identity=76.9; qcov=0.145; evalue=3.38e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987977 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767693.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057767693.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057767693.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057767693.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767693.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:3503369 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B12,B80,C41 |
Chr6:3503524 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B137,B35,B82,C85,D7 |
Chr6:3503543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr6:3503566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 152 | A10,A11,A13,A14,A16,A2,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B119,B120,B123,B126,B127,B128,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B20,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B32,B34,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B46,B47,B48,B5,B51,B52,B53,B59,B6,B61,B62,B65,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B78,B79,B81,B84,B87,B91,B92,B93,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C18,C19,C2,C24,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C34,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C55,C56,C6,C61,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C8,C80,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D2,D3,D4,D6,D7,D9 |
Chr6:3503746 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B66,B76,C14 |
Chr6:3503767 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,C75 |
Chr6:3503838 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B82,C74 |
Chr6:3503859 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr6:3503860 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr6:3503871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A22,A8,B111,B121,B132,B21,B27,B4,B68,B84,B92,C1,C11,C14,C22,C41,C49,C52,C58,D1,D9 |
Chr6:3503899 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr6:3503905 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B68,C52 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。