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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000431`

染色体: Chr06 坐标: 3548153-3550816 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000431`
名称	SmilChr06G000431
描述	mitochondrial import inner membrane translocase subunit PAM16 like 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3548153 - 3550816 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987985`
GeneID	`130987985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987985`
原始查询	`LOC130987985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial import inner membrane translocase subunit PAM16 like 1-like
产物	mitochondrial import inner membrane translocase subunit PAM16 like 1-like
Arabidopsis	`AT5G61880` (AT5G61880) Protein Transporter, Pam16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836309] identity=74; qcov=0.912; evalue=1.74e-51; confidence=high
Rice	`Os10g0479600` - identity=66.1; qcov=0.982; evalue=5.31e-51; confidence=high
GO	GO:0005744 (TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF03656 (Pam16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767702.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057767702.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057767702.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767702.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767702.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3548456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B35,B82,C85,D7
`Chr6:3548484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B137,B86,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767702.1

114 aa

114

Pam16

PF03656 Pam16 1-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767702.1`	Pfam	`PF03656`	Pam16	Family	1	105	7e-22	78.5	Pam16

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911719.1
TCAAGAACTCCAAGTCATCACTCTTTTTTATTTATATTTATTTTACCTGAAAAAATATTTATTTATTGAAGGCCTAAACATATTCTGCTTTCTTTCACAGCTCTCACACGACATTAACTCTTTCCCAAGAAAAGAAACAACCTCTTATTTTTTTTCGGACCCTTTTGCTAATCTTAATCGCGAGACGTTTTCCTCTTCTTGAGCTTCAATTTCTCTGAGTTATTTGGTATATTCAAGGTTATTTGGAGTTCATAAATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987985
ATGGCTGCTAGGATTCTTGCTAACTTGATTGTCATGGGCTCTGGAATAATGATAAGAGCTTTTGCTCAAGCATATCGTCAGGCACTTGCAAACGCCTCAAAGACTGGTGCTGCACAAGAAGCTGTGGAAACTATCAAACGAGGTAGTAAAATGATGACTGAGGCGGAGGCTAGGCAAATACTTGGTGTCACTGAGAATACACCATGGGAAGAGATTGTGAAGAGGTATGACAAACTGTTTGAGAGGAATACTCAAAGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767702.1
MAARILANLIVMGSGIMIRAFAQAYRQALANASKTGAAQEAVETIKRGSKMMTEAEARQILGVTENTPWEEIVKRYDKLFERNTQSGSFYLQSKVVRAKECLESVEKPKQQNPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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