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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000442`

染色体: Chr06 坐标: 3610290-3612628 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000442`
名称	SmilChr06G000442
描述	succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3610290 - 3612628 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987995`
GeneID	`130987995`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987995`
原始查询	`LOC130987995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial-like
产物	succinate dehydrogenase assembly factor 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G51040` (SDHAF2) succinate dehydrogenase assembly factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835177] identity=70.7; qcov=0.782; evalue=8.07e-76; confidence=high
Rice	`Os11g0528300` - identity=64; qcov=0.838; evalue=4.68e-67; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0006121 (mitochondrial electron transport, succinate to ubiquinone); GO:0018293 (protein-FAD linkage); GO:0034553 (mitochondrial respiratory chain complex II assembly)
KEGG	-
Pfam	PF03937 (Sdh5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987995

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767714.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057767714.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767714.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3610439`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr6:3610439`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr6:3610442`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B58
`Chr6:3610442`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B58
`Chr6:3612221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,C15,D11,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767714.1

179 aa

179

Sdh5

PF03937 Sdh5 65-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767714.1`	Pfam	`PF03937`	Sdh5	Domain	65	139	8.3e-23	80.8	Flavinator of succinate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911731.1
TAATCTATGTCACTTAACGAACCAAACGGTAACGAAAAATTTGAGGCACCGAACTCCAGCGACGTCTCTCCGCTGCCGTCGGCGGCGACTTTAGCTAGCTGGTAATCGCTTCACCGGAAAAATTATCTCTTTCCCCGCAATAAAATGGAAAATTTAAGAAGAGTCCTAATCTCCACTGTTCCCCGCCTTCTCAGCACCAATCGAACATCCGCCGCCACCGCCTCCGGTCTTCACAGACCCGTATCAGGTTCCTTCACGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987995
ATGGAAAATTTAAGAAGAGTCCTAATCTCCACTGTTCCCCGCCTTCTCAGCACCAATCGAACATCCGCCGCCACCGCCTCCGGTCTTCACAGACCCGTATCAGGTTCCTTCACGCGTTTCTGTTCTTCGAATGAGGGAAACCGATCATTGGAGATTGATCTCTGCGATGAAGAAAGTAAAAGGCGCTTGTTCAATAGGCTTTTGTATAGAAGTAAGCAAAGGGGTTTCTTGGAGCTGGATTTGATTCTGGGTAAATGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767714.1
MENLRRVLISTVPRLLSTNRTSAATASGLHRPVSGSFTRFCSSNEGNRSLEIDLCDEESKRRLFNRLLYRSKQRGFLELDLILGKWVEDHIHSMDESGIKSLVHVLDLENPDLWRWLTCQEQPPEAVNQNPVFVSLREKVVNNLDNHAAPETRATTGQPWVRGWDDFKKGRDSPITGNQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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