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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000448`

染色体: Chr06 坐标: 3628508-3634391 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000448`
名称	SmilChr06G000448
描述	calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3628508 - 3634391 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987998`
GeneID	`130987998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987998`
原始查询	`LOC130987998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 3
产物	calcium-dependent mitochondrial ATP-magnesium/phosphate carrier protein 3
Arabidopsis	`AT5G51050` (APC2) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835178] identity=74.6; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0604500` - identity=72.4; qcov=0.954; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005347 (ATP transmembrane transporter activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr); PF13202 (EF-hand_5); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767717.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057767717.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057767717.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767717.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3628833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B87,C1
`Chr6:3628858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B60,B87,C1
`Chr6:3628862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B12,B68,C54
`Chr6:3628875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:3628878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C1,C22
`Chr6:3628889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:3628942`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	122	A1,A10,A11,A20,A23,A3,A6,A9,B1,B101,B104,B106,B107,B109,B111,B113,B115,B117,B118,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B134,B136,B137,B138,B139,B17,B18,B20,B25,B26,B29,B3,B30,B34,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B45,B48,B49,B50,B51,B54,B55,B56,B59,B60,B62,B65,B66,B68,B73,B79,B80,B84,B85,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C13,C18,C20,C23,C27,C28,C3,C30,C34,C35,C38,C41,C44,C47,C49,C5,C50,C52,C54,C55,C57,C58,C59,C63,C64,C65,C66,C67,C71,C72,C75,C77,C79,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D3,D5,D7,D8,D9
`Chr6:3628962`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C1,C50
`Chr6:3628962`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C1,C50
`Chr6:3628974`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	94	A1,A10,A11,A3,A6,A9,B1,B101,B104,B106,B111,B113,B115,B118,B120,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B134,B136,B138,B139,B17,B18,B20,B26,B3,B30,B34,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B45,B48,B49,B50,B51,B56,B60,B65,B68,B73,B79,B80,B84,B85,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B99,C10,C13,C14,C18,C20,C23,C27,C3,C35,C38,C41,C44,C47,C49,C5,C54,C55,C57,C58,C63,C64,C66,C67,C71,C72,C75,C77,C79,C83,C84,C87,D1,D3,D5,D8
`Chr6:3628990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B52
`Chr6:3629013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B103,B127,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767717.1

505 aa

252

505

EF-hand_5

EF-hand_7

EF-hand_8

EF-hand_5

Mito_carr

PF13202 EF-hand_5 106-120 aa PF13499 EF-hand_7 128-184 aa PF13833 EF-hand_8 141-189 aa PF13202 EF-hand_5 172-189 aa PF00153 Mito_carr 227-312 aa PF00153 Mito_carr 321-407 aa PF00153 Mito_carr 418-502 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	106	120	1.1e-09	38.0	EF hand
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	128	184	4.2e-18	66.2	EF-hand domain pair
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	141	189	1.6e-07	31.7	EF-hand domain pair
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	172	189	1.1e-09	38.0	EF hand
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	227	312	6.9e-76	250.8	Mitochondrial carrier protein
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	321	407	6.9e-76	250.8	Mitochondrial carrier protein
`XP_057767717.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	418	502	6.9e-76	250.8	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089902.1
ATTTCTTTAGCCAGAAGATCCTTCCCCAAAATTCCATTATTCCCCGTCTTTTCCTTCCTCCATTAACACCTACAGTTTCTCACTTTCTCTCTCTAGCAGATCTCGAAAAAACTCATAATTCCACTGCTTTCCTCATCATGCCGTGAAGATCAAATTTCCACAATTCGGAAATTCTGAAAATCCCCAATTTTCGCCCATCCCGATTATTTATGACTACGGGAGTCGAGAGGCATGCCAATTTCCCAGCACCAGCAGCTCCG...

XM_057911734.1
GGGAGAGAGTGTGTCAACTGCCTGTTGAAAGTTTGAAAGTGGACTCCTTCAGTTTTGACCCGATAAAAAAAAACAAAACGAATCGGAGCTCCGGTTAGCGATTCGGGTAATTTCTTTAGCCAGAAGATCCTTCCCCAAAATTCCATTATTCCCCGTCTTTTCCTTCCTCCATTAACACCTACAGTTTCTCACTTTCTCTCTCTAGCAGATCTCGAAAAAACTCATAATTCCACTGCTTTCCTCATCATGCCGTGAAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987998
ATGACTACGGGAGTCGAGAGGCATGCCAATTTCCCAGCACCAGCAGCTCCGACAATGGCGCCCGAAGCGAAGGACCCGACGAACCGATCCGGATGCTGCGACCCGGTTAAGAAGCCGGGCCCCGTGACGCTCGACCACGTGCTCTCCGCCCTGCGCGAGACCAAGGAGGAGCGGGACTCCAGAATTCGGAGTCTGTTCAGTTTCTTCGACTCGAACAATCTAGGGTATTTGGATTCCGCGCTGATTGAGAAGGGGCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767717.1
MTTGVERHANFPAPAAPTMAPEAKDPTNRSGCCDPVKKPGPVTLDHVLSALRETKEERDSRIRSLFSFFDSNNLGYLDSALIEKGLSAMQIPADYKFAKELLLVCDANQDGRVDYQEFRKYMDDKELELYRIFQAIDVEHNGCILPEELWDALVKAGIELDDDELASFVEHVDKDNNGIITFEEWRDFLLLYPHEATIENIYRYWERVYLVDIGEQAVIPQGISRHVHATKYLIAGGVAGAASRTATAPLDRLKVTLQVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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