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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002896`

染色体: Chr01 坐标: 47656766-47659088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002896`
名称	SmilChr01G002896
描述	peroxiredoxin Q, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47656766 - 47659088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988001`
GeneID	`130988001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988001`
原始查询	`LOC130988001`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxiredoxin Q, chloroplastic
产物	peroxiredoxin Q%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G26060` (PRXQ) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822203] identity=75.7; qcov=0.864; evalue=1.17e-99; confidence=high
Rice	`Os06g0196300` (OsPrx) - identity=69.6; qcov=0.907; evalue=6.32e-96; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008379 (thioredoxin peroxidase activity); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0045454 (cell redox homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767723.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057767723.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767723.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767723.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47656972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47657078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47657085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47657108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47658424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:47658481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:47658722`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr1:47658722`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767723.1

214 aa

107

214

Redoxin

AhpC-TSA

PF08534 Redoxin 69-199 aa PF00578 AhpC-TSA 70-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767723.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	69	199	4.5e-26	92.1	Redoxin
`XP_057767723.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	70	191	3.8e-42	143.9	AhpC/TSA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911740.1
AGGCTTCTTAATATTGGAAGTGAAGAAGGTGTAGGTAGTATAGCATAGCATGTTATAAAAAATTAAAATGGTGGGTTAGCAATTGTCCACGCCACGGCACATCTCATCCCCGTCTTCCCCAATCCCACCACCTGCTTCATCTCATCTCTGCCTTATCTTTTTTTAACGGAATTCCAAAATTAAATATCACCTCTCAAGAAACTCTTCTTGCAGCTCAACTGAAGAATAGGAGATACAGAGAGGTCTCAGAGTCAGTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988001
ATGGCTTCAATTTCTCTTCACGCAACTCACTCCTTCCCTTCTTCACTCCACACTCAAACCCCTAAACCAGCATTCTCTCACAATCTTTCCCTTCTCTCAAAATCTTCGCAATCTCAATTCCACGGCCTAAAGCTCTCTACTTCGTCCCACCTCTCAATCCCATATCCCCTTCCTGCGAAATCCGCCATTGTTGCCAAGGTGTCTGAAGGGACACAGGCACCATCATTTACATTGAAAGATCAAAATGGGAGGACTGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767723.1
MASISLHATHSFPSSLHTQTPKPAFSHNLSLLSKSSQSQFHGLKLSTSSHLSIPYPLPAKSAIVAKVSEGTQAPSFTLKDQNGRTVSLSKFKGKPVVVYFYPADETPGCTKQACAFRDSYEKFKKAGAEVVGISGDEASSHKAFAEKYKLPFTLLSDEGNKVRKEWGVPSDLFGALPGRQTYVLDKNGVCRLVYNNQFQPEKHIDETLKFLKSV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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