当前解析结果
SmilChr06G000454| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000454 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000454 |
| 描述 | germin-like protein subfamily 3 member 4 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 3675589 - 3676510 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988003 |
|---|---|
| GeneID | 130988003 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988003 |
| 原始查询 | LOC130988003 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | germin-like protein subfamily 3 member 4 |
| 产物 | germin-like protein subfamily 3 member 4 |
| Arabidopsis | AT5G61750 (AT5G61750)RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836297] identity=56.2; qcov=0.828; evalue=3.25e-70; confidence=high |
| Rice | Os11g0537350 (OsGLP11-1)- identity=52; qcov=0.93; evalue=2.9e-67; confidence=high |
| GO | GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00190 (Cupin_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988003 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057767722.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057767722.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767722.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767722.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767722.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767722.1PF00190
Cupin_1 65-186 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767722.1 |
Pfam | PF00190 |
Cupin_1 | Domain | 65 | 186 | 4.2e-34 | 118.0 | Cupin |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。