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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000460`

染色体: Chr06 坐标: 3722001-3729421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000460`
名称	SmilChr06G000460
描述	4-coumarate--CoA ligase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3722001 - 3729421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988012`
GeneID	`130988012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988012`
原始查询	`LOC130988012`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-coumarate--CoA ligase-like
产物	4-coumarate--CoA ligase-like
Arabidopsis	`AT3G21240` (4CL2) 4-coumarate:CoA ligase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821678] identity=70.2; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0177600` (4CL3) - identity=64.1; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767738.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767738.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767738.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767738.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3722195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr6:3722217`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B128
`Chr6:3722217`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B128
`Chr6:3722517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B29,B69,C49,C9
`Chr6:3722550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:3722607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3722658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:3722682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C15,C80,C87
`Chr6:3722710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:3722856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:3723013`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr6:3723013`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767738.1

549 aa

274

549

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 33-405 aa PF13193 AMP-binding_C 456-531 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767738.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	33	405	9.2e-97	325.0	AMP-binding enzyme
`XP_057767738.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	456	531	6.4e-20	72.6	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911755.1
TTTTCAGGTTCAACTCACACACAAAATTCAAAGTTGACACCAATTTTTTCCCTCAATTTTTTCCAACAAAAAAGAAAAAATGGAGACCGCAACCAGAAAAGATGACGTCATTTTCCGATCAAAACTCCCCGACATCTACATTCCCAAGCACCTGCCGCTGCATTCCTACTGCTTCGAGAACATCTCCAAGTATCGAACGAAGCCGTGCTTGATCAACGGCGGCACCGGCGACGTCTACACCTACGAGGAGGTGGAGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988012
ATGGAGACCGCAACCAGAAAAGATGACGTCATTTTCCGATCAAAACTCCCCGACATCTACATTCCCAAGCACCTGCCGCTGCATTCCTACTGCTTCGAGAACATCTCCAAGTATCGAACGAAGCCGTGCTTGATCAACGGCGGCACCGGCGACGTCTACACCTACGAGGAGGTGGAGGCGATCTCGAGGAGAGCGGGGGCGGGGCTGAGCCGCCTCGGCCTCCGCCACGGCGACACCGTCATGATCCTCCTCCCGAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767738.1
METATRKDDVIFRSKLPDIYIPKHLPLHSYCFENISKYRTKPCLINGGTGDVYTYEEVEAISRRAGAGLSRLGLRHGDTVMILLPNSPEFVFAFLGASYIGAVSTMANPYFTSAEVVKQAKASNAKLIVTQACHVGKVNGYASDHGVRVMLVDSPPPDAAAADYLQFSDLISADEKELPAVEICPDDVVALPYSSGTTGMPKGVMLTHKGLVTSVAQQVDGENPNLYIHSDDVMICVLPFFHIYSLNSILLCGLRAGAAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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