当前解析结果
SmilChr06G000466| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000466 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000466 |
| 描述 | fasciclin-like arabinogalactan protein 14 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 3804753 - 3806137 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988017 |
|---|---|
| GeneID | 130988017 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988017 |
| 原始查询 | LOC130988017 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | fasciclin-like arabinogalactan protein 14 |
| 产物 | fasciclin-like arabinogalactan protein 14 |
| Arabidopsis | AT3G12660 (FLA14)FASCICLIN-like arabinogalactan protein 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820446] identity=50.3; qcov=0.371; evalue=3.15e-48; confidence=low |
| Rice | Os02g0461500 (OsFLA20)- identity=47.1; qcov=0.376; evalue=8.11e-43; confidence=low |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988017 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057767742.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057767742.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767742.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767742.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767742.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:3804962 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr6:3804979 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B16,B91 |
Chr6:3805002 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B49,B79,C78 |
Chr6:3805136 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B84,C19 |
Chr6:3805157 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B67,C82 |
Chr6:3805175 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B140,B16,B91 |
Chr6:3805368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr6:3805401 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,B94 |
Chr6:3805427 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B86,C51 |
Chr6:3805433 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B66,B94 |
Chr6:3805442 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,B91 |
Chr6:3805545 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,C40,C61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。