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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000468`

染色体: Chr06 坐标: 3810922-3814488 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000468`
名称	SmilChr06G000468
描述	very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3810922 - 3814488 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988020`
GeneID	`130988020`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988020`
原始查询	`LOC130988020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3-like
产物	very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3-like
Arabidopsis	`AT5G57800` (CER3) Fatty acid hydroxylase superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835889] identity=67; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0426800` (WSL2) - identity=63.5; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0008610 (lipid biosynthetic process); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04116 (FA_hydroxylase); PF12076 (CER1-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988020

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767746.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057767746.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767746.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767746.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3811196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B86
`Chr6:3811434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B72,C25
`Chr6:3811481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B65,B98
`Chr6:3811780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:3811792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C29
`Chr6:3811974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C47
`Chr6:3812068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B90,B92,C44,D8
`Chr6:3812104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:3812434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B137,B67
`Chr6:3812436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B2
`Chr6:3812469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr6:3812482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767746.1

630 aa

315

630

FA_hydroxylase

CER1-like_C

PF04116 FA_hydroxylase 139-279 aa PF12076 CER1-like_C 459-629 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767746.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	139	279	7.5e-17	62.7	Fatty acid hydroxylase
`XP_057767746.1`	Pfam	`PF12076`	CER1-like_C	Domain	459	629	1.4e-67	227.3	CER1-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911763.1
CTAGTATATTTCAAGAATTGATTTCTGACATGGTATTTATTTAATGTTGTTGCTGATCCTAGAAAATCTAAGCCAAAAGTTTGAGACAGTAAAGAAATGGGAATATAAAAAAGGTAATTAAAGCAATAACCGTCATATAAAGGTGATAGTGTAGGACAAACTAACACATCCACATCTCTCAACTACAATCTGCAATCCACTAACTAGAACTCCCATAAAAGCTTAGGCAGCCAACCATCTCAATATTCTTCTCACTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988020
ATGGGGAGTGAGAAAGATTGCAGTGTTCCATGCAGGAGTGAAGCTTCTTTGTTTTCTTGGCCGTGGGAGAACTTGGGTAGTTTAAAGTATGTGTTATATGCTCCATTAGTTGCAAATGCCCTTTACGCTATGTATAGAGGTGAGATCAAGAATGGGGCATGGTGCTTGCATATTCTCATCTTGTTTGGGGCTAGAGCCCTTGTTCATCAACTTTGGGGGAGCTATTCTAGCATGCTTTTCCTTAATCGAAATCGAAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767746.1
MGSEKDCSVPCRSEASLFSWPWENLGSLKYVLYAPLVANALYAMYRGEIKNGAWCLHILILFGARALVHQLWGSYSSMLFLNRNRRIDQKGLEFKQIDSEWHWDNFLMLQLIVASLVYLSLPLSDFPIFDSRGFLWCLILHIGISEPLYYWLHRLLHSPALFQHYHWLHHSSRVLHPFTAGHATFLEHLLLCVVVGIPTLGTTYFGYGSISLMYSYLLAFDFLQCLAHCNVEVFPSHLFVDFPLLKHIIRTPTYHSLHHT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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