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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000470`

染色体: Chr06 坐标: 3827931-3831893 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000470`
名称	SmilChr06G000470
描述	uncharacterized SmilChr06G000470
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3827931 - 3831893 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988021`
GeneID	`130988021`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988021`
原始查询	`LOC130988021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serinc-domain containing serine and sphingolipid biosynthesis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838187]; symbol=AT1G16180; hit=AT1G16180; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Serinc-domain containing serine and sphingolipid biosynthesis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838187]; symbol=AT1G16180; hit=AT1G16180; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G16180` (AT1G16180) Serinc-domain containing serine and sphingolipid biosynthesis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838187] identity=84.1; qcov=0.954; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0792900` - identity=78.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03348 (Serinc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988021

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767747.1`
2	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057767747.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057767747.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057767747.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767747.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3828184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,C82
`Chr6:3828202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C47,C57
`Chr6:3828286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:3828382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C37
`Chr6:3828390`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A18,C37
`Chr6:3828390`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A18,C37
`Chr6:3828430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D10
`Chr6:3828439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr6:3828891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3828915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:3828986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D11
`Chr6:3830529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C47,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767747.1

416 aa

208

416

Serinc

PF03348 Serinc 8-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767747.1`	Pfam	`PF03348`	Serinc	Domain	8	414	1.7e-122	410.2	Serine incorporator (Serinc)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911764.1
TCCGTTTTGGGGTAAACTCAAAATAACATAAAAGTACAGGGGTGCATATGTAATATATATGGAAAACATGAATTTGGGGTATTCCAGAATTGATCAGGACTATTATTCTTCTCTGCAGCTTACACGCCTTTTCTCAATCTTCCATTCCTCCTCGCCCAGTAAGCTGTAGGGTTTGAATTATATCTGCAACACCAGTTTGATCATCGATCGCGGAGGTCTCGCATAGAAGCAAGATGTGGGCTGCTTCGTGCCTGGCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988021
ATGTGGGCTGCTTCGTGCCTGGCATCATGCTGCGCTGCCTGTGCTTGCGACGCGTGCCGCACGGTCGTGTCAGGGATTAGTCGGCGATCCGCTCGCATTGCCTACTGCGGTCTCTTCGCGCTTTCGCTGATTGTTTCGTGGATTCTCCGCGAGGTGGCTGCTCCCCTCATGGAGAAGATCCCATGGATCAATCATTTTCACCAAACTCCAGATAGAGAATGGTTTGAGACAGATGCAGTATTGAGAGTGAGCTTGGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767747.1
MWAASCLASCCAACACDACRTVVSGISRRSARIAYCGLFALSLIVSWILREVAAPLMEKIPWINHFHQTPDREWFETDAVLRVSLGNFLFFTILAIFMIGVKNQKDPRDNLHHGGWMMKIICWCILVILMFFLPNGIVSFYEATSKFGSGLFLLVQVVLLLDFVHGWNDKWVGYGEQFWFAALLVVSLVCYVATFLFSALLFYLFTPSGVDCGLNTFFIVITLIFVFVFTIVTLHPSVCGSILPSSVISLYCMYLCYSGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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