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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002904`

染色体: Chr01 坐标: 47739588-47750761 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002904`
名称	SmilChr01G002904
描述	uncharacterized SmilChr01G002904
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47739588 - 47750761 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988029`
GeneID	`130988029`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988029`
原始查询	`LOC130988029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814843]; symbol=AT2G03140; hit=AT2G03140; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814843]; symbol=AT2G03140; hit=AT2G03140; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G03140` (AT2G03140) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814843] identity=42.3; qcov=1.07; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os09g0436800` - identity=49.8; qcov=0.179; evalue=5.7e-102; confidence=weak
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0071586 (CAAX-box protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF02517 (Rce1-like); PF24930 (DUF7750)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988029

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767762.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057767762.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767762.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767762.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767762.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47739909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:47739920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47739977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B64,C22,C9
`Chr1:47739995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr1:47740157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B47,B9,C56
`Chr1:47742282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B40,B57
`Chr1:47742628`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr1:47742628`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C41
`Chr1:47742684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A24,B26
`Chr1:47743208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C5
`Chr1:47743520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B126,C6,C63,C67
`Chr1:47743586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767762.1

1730 aa

865

1730

DUF7750

Rce1-like

PF24930 DUF7750 575-639 aa PF02517 Rce1-like 1580-1664 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767762.1`	Pfam	`PF24930`	DUF7750	Domain	575	639	8.1e-36	122.4	Domain of unknown function (DUF7750)
`XP_057767762.1`	Pfam	`PF02517`	Rce1-like	Family	1580	1664	6.4e-07	30.3	Type II CAAX prenyl endopeptidase Rce1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911779.1
ATATTTTTCAATATATTATAGAGTATAAAATAGATTATAGATTTCAATTTTCAACAAGTCTTTTTCAAATAGAAGACACCAGATCCGAGGCACCGAACTCCACAAGCTTGGATTCGGACAATCCAGAACTTGCCAAACGGAAGGAACCGCACAGTACGTAACTGCAGACACCGCGCCAAAATTCTCAACCGTCAAAACGAACCACTCATCATGAACACTCTCCACCGCCACCACCTCCTCCGCCGCTGATCACCGCCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988029
ATGACCCTGGCGTCCAGACAGGCCGTATTCCTCCTCCCACCTTCGTCTCTCCACCGACATGGCATACCGCCATGCCAGCACCGCCGTGCATGGAAGCGCCGCCGTCTCAAGCCCCCCACCGTCCACAGCGAGTTCAATCCCGCGCCACCGCCTCTCGATAATTTCTTCCAAGGCTTGCTCTCCCAGCTCCCCTCTGTTAATTCGCTTGATTTAATCGCCCCGGCAGTCGGCTTCACCTCCGGCATCGCTTTATTTCTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767762.1
MTLASRQAVFLLPPSSLHRHGIPPCQHRRAWKRRRLKPPTVHSEFNPAPPPLDNFFQGLLSQLPSVNSLDLIAPAVGFTSGIALFLSSKTPKLLPSPTSSSDIGEWILFTSPTPFNRFVTLRCPSIDFPENELMENVSEKLVKEDRHYVKLNSGRIIQPVESSDGSEDEKLVYQRLCVGTEDGGVLSLDWPANLDLEEERGFDTTALIVPGTVEGSSERKIRAFVCDCLRRGVFPLVMNPRGCAASPLTTPRLFTAADSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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