当前解析结果
SmilChr01G000769| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000769 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000769 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000769 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 16822923 - 16823270 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988061 |
|---|---|
| GeneID | 130988061 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988061 |
| 原始查询 | LOC130988061 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988061 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767834.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057767834.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057767834.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767834.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057767834.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:16822929 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B19,B27 |
Chr1:16822953 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,B55 |
Chr1:16822968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | A10,A4,B105,B113,B122,B123,B128,B138,B26,B41,B42,B43,B47,B49,B61,B62,B72,B85,B90,B92,C16,C29,C38,C56,C61,C62,C63,C65,C67 |
Chr1:16823036 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,A2,B31,B33 |
Chr1:16823093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr1:16823098 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B108,B122,B13,B26,B4,B41,B98,C23,C36,C48,C87 |
Chr1:16823103 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:16823160 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B50,C48,C61 |
Chr1:16823211 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B80,C53 |
Chr1:16823244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 28 | A23,B109,B119,B120,B127,B132,B19,B22,B27,B42,B43,B6,B67,B69,B71,B86,C13,C16,C26,C30,C41,C44,C51,C57,C64,C66,C70,C77 |
Chr1:16823252 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr1:16823260 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B74,B95,B99,C58 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。