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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000536`

染色体: Chr06 坐标: 4474124-4482699 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000536`
名称	SmilChr06G000536
描述	serine carboxypeptidase 24
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4474124 - 4482699 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988080`
GeneID	`130988080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988080`
原始查询	`LOC130988080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase 24
产物	serine carboxypeptidase 24
Arabidopsis	`AT4G30610` (BRS1) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829184] identity=68.9; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0794500` (OsSCP10) - identity=69.6; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis); GO:0009742 (brassinosteroid mediated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057767819.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057767818.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767818.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767818.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767818.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4474534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:4474536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:4474546`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B128,B137,B4,B72,C19
`Chr6:4474546`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B128,B137,B4,B72,C19
`Chr6:4474897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B113,B132,B59
`Chr6:4475850`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A10,A6,B126,B16,B18,B83,B95,C26,C35,C40,C41,C47,C59,C64,C66,C81
`Chr6:4475983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C23
`Chr6:4476138`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A18,A21,A8,B108,B109,B115,B126,B15,B20,B22,B28,B30,B58,B63,B77,B78,B80,B83,B95,C1,C13,C16,C77,C78,C79
`Chr6:4476160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:4476186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:4476529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:4476543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B137,B4,B72,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767818.1

461 aa

230

461

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 37-454 aa

XP_057767819.1

416 aa

208

416

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 37-406 aa

XP_057767820.1

389 aa

194

389

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 37-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767818.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	37	454	1.2e-149	500.0	Serine carboxypeptidase
`XP_057767819.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	37	406	5.2e-129	432.0	Serine carboxypeptidase
`XP_057767820.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	37	379	2.1e-119	400.4	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911835.1
ACTGCCTCCCTCATTTATATATATGGACGATTGCACCTCCATCTCTCTCTCTTTCTCACACACATACACACATGAGGGATTAGGGATGGCCAATGAGGTCCACACCCAACAAGGGAATTAATGTAGTATAGTGAGGGCTAGAGAGCTCAACAAACTCTATTACAACCCTATTATTGTGTTATTAATTAGTACATCATTATTAATATTGTACACAATTAGTGTACAGCCCTAGTTTATAAATATATTGCTTCACTGCACAC...

XM_057911837.1
ACACATGAGGGATTAGGGATGGCCAATGAGGTCCACACCCAACAAGGGAATTAATGTAGTATAGTGAGGGCTAGAGAGCTCAACAAACTCTATTACAACCCTATTATTGTGTTATTAATTAGTACATCATTATTAATATTGTACACAATTAGTGTACAGCCCTAGTTTATAAATATATTGCTTCACTGCACACCAATTTCTTGTGGGAAAAAAAAAGTGTAGACAGACAAAGATTTTCGTCAATGGCGTTGCGGCGACTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988080
ATGGCGTTGCGGCGACTTCTCTTTTTGTGCCTCATTTTTTTCTCATTCACCAAAATCATCGCACTGCCTAAAGAGCAAGAATTGGACCGCATTTCGGCGCTGCCGGCGCAGCCTCCGGTGAAATTCTCGCTGTTTTCCGGCTACGTTACCGTCGACGAAGAAGACGGCCGCGCTCTCTTTTACTGGCTGACTGAGGCCACCCACAATGCACACACAAAGCCTCTTGTTCTTTGGCTCAATGGAGGACCTGGATGTTCATC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767818.1
MALRRLLFLCLIFFSFTKIIALPKEQELDRISALPAQPPVKFSLFSGYVTVDEEDGRALFYWLTEATHNAHTKPLVLWLNGGPGCSSVAYGASEEIGPFRINKNGSLYLNKYSWNRVANIIFLESPAGVGFSYTNTSSNLKNSGDKRTAQDALKFLIRWMSRFPQYKYRDFYISGESYAGHYVPQLAEQIYDHNKKAPHPIINLKGFIVGNGVTDNYYDGIGTVTYWWSHAMISDKTYKSILKNCDFRSQQTSHECDEAV...

XP_057767819.1
MALRRLLFLCLIFFSFTKIIALPKEQELDRISALPAQPPVKFSLFSGYVTVDEEDGRALFYWLTEATHNAHTKPLVLWLNGGPGCSSVAYGASEEIGPFRINKNGSLYLNKYSWNRVANIIFLESPAGVGFSYTNTSSNLKNSGDKRTAQDALKFLIRWMSRFPQYKYRDFYISGESYAGHYVPQLAEQIYDHNKKAPHPIINLKGFIVGNGVTDNYYDGIGTVTYWWSHAMISDKTYKSILKNCDFRSQQTSHECDEAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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