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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000566`

染色体: Chr06 坐标: 4817085-4827917 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000566`
名称	SmilChr06G000566
描述	FIP1[V]-like protein
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4817085 - 4827917 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988110`
GeneID	`130988110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988110`
原始查询	`LOC130988110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FIP1[V]-like protein
产物	FIP1[V]-like protein
Arabidopsis	`AT5G58040` (FIP1[V]) FIP1[V]-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835916] identity=59.7; qcov=0.248; evalue=1.57e-110; confidence=weak
Rice	`Os03g0725100` - identity=34.2; qcov=0.485; evalue=3.92e-54; confidence=low
GO	GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF05182 (Fip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767852.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057767852.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767852.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767852.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4817505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B36,B72,C16,C77
`Chr6:4818014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:4818068`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B20
`Chr6:4818068`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B20
`Chr6:4820342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:4820541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B32,C46
`Chr6:4821038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:4821084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B67,C44
`Chr6:4822569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B44,C24,C42,C46
`Chr6:4822750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:4822784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:4824035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767852.1

1411 aa

706

1411

Fip1

PF05182 Fip1 420-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767852.1`	Pfam	`PF05182`	Fip1	Motif	420	462	2e-21	75.9	Fip1 motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911869.1
TCTCCATTTGTACACTATTTTCTTCTCCTTCCCCTCCCTATATATAAAATCCCACTTCCCCCTTTTACCTTAACCATTGCCCAAAACCCCTCTATTTTTCCGTGTAACCTAAAGCGCGCGCGTTCATGGAGGACGACGATGAGTTCGGAGATCTCTACACAGACGTCCTCCGCCCCCTCGAGGCGCAGTTTCAGCCGCAGCGCGAGCAACACGCGCCCGCCTCAGCTGCTGGAAAGGCGCCGCCGCCGCAGGGCCGGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988110
ATGGAGGACGACGATGAGTTCGGAGATCTCTACACAGACGTCCTCCGCCCCCTCGAGGCGCAGTTTCAGCCGCAGCGCGAGCAACACGCGCCCGCCTCAGCTGCTGGAAAGGCGCCGCCGCCGCAGGGCCGGCCGATCGATCTCAACATCGATAGCGACGATGAGGAGATTCTGTACGGAGCTTCGGATTCGACGACTCGGAAGTCGAATCCCCCCAGTGGGAACTCGGACGCCTTGATTCGAGAGAAAACCCTTCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767852.1
MEDDDEFGDLYTDVLRPLEAQFQPQREQHAPASAAGKAPPPQGRPIDLNIDSDDEEILYGASDSTTRKSNPPSGNSDALIREKTLPEPRGIDLNLDSNPGTARIDGLVGKGGDGSGFDARVLEKGRGLELRDKASGESSFMEDEDDINIIVEEREDKDGDLVENDASLTSKDEKMYATTVQEGNTMNLLNDAGEMGTQQMIPGLSGGLENPRPPNIEDEWESEESDDDLQIVLNDNHHGPMGMERMPGVIDDDDEDGEPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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