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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000567`

染色体: Chr06 坐标: 4829180-4836526 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000567`
名称	SmilChr06G000567
描述	FIP1[V]-like protein
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4829180 - 4836526 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988111`
GeneID	`130988111`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988111`
原始查询	`LOC130988111`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FIP1[V]-like protein
产物	FIP1[V]-like protein
Arabidopsis	`AT5G58040` (FIP1[V]) FIP1[V]-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835916] identity=51; qcov=0.327; evalue=2.7e-85; confidence=low
Rice	`Os03g0308900` - identity=34.9; qcov=0.136; evalue=8.8e-18; confidence=weak
GO	GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF05182 (Fip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988111

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767854.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057767854.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767854.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767854.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4829348`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A1,A18,A20,A21,A24,A5,A7,A8,B100,B101,B105,B108,B110,B114,B125,B127,B128,B13,B130,B14,B15,B17,B18,B22,B24,B30,B35,B36,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B48,B50,B62,B63,B64,B66,B70,B71,B72,B76,B81,B82,B84,B97,C16,C17,C19,C20,C24,C27,C29,C32,C38,C41,C42,C46,C52,C54,C62,C68,C77,C82,C84,C87,D1,D4,D5,D7,D8
`Chr6:4829350`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	58	A1,A20,A21,A24,A5,A7,A8,B100,B105,B108,B110,B127,B128,B13,B130,B14,B15,B18,B22,B30,B35,B36,B4,B42,B43,B44,B50,B62,B63,B70,B71,B72,B81,B82,B84,C16,C17,C19,C24,C27,C29,C32,C41,C42,C46,C52,C54,C68,C77,C8,C82,C84,C87,D1,D4,D5,D7,D8
`Chr6:4829406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:4829590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:4829772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:4829961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:4830168`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr6:4830168`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr6:4830229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:4831626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B100,B108,C27,D7
`Chr6:4831683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B100,B108,C27,D7
`Chr6:4831704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767854.1

1075 aa

538

1075

Fip1

PF05182 Fip1 412-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767854.1`	Pfam	`PF05182`	Fip1	Motif	412	454	7.3e-20	70.9	Fip1 motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911871.1
GAGCATATAAAATGTCACAGTCGCTATTGGCGTTTTAACCATCTCCCAAAACCCGCATTTCTCTGTGTAACTGAAGCGCGCGCGTTCATGGAGGAAGATGAGTTCGGAGATCTCTACATGGACGTTATTCGCCTCATCGAGGCGCGGTTTCAGCCGCAGCACAAGGACTCCTGGGCCGGACGCAGCTGCCGTGAAGGCGGCGGCGTCGCAGGACCGATCGGTTGATCTTAACTTCGACAATGACGATGAGAAGACTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988111
ATGAGTTCGGAGATCTCTACATGGACGTTATTCGCCTCATCGAGGCGCGGTTTCAGCCGCAGCACAAGGACTCCTGGGCCGGACGCAGCTGCCGTGAAGGCGGCGGCGTCGCAGGACCGATCGGTTGATCTTAACTTCGACAATGACGATGAGAAGACTCCGCATTTGAAAGCCGGTACTGCCCCAGGCCGGAACTTGAATTCCTACACTCAAGAAAAAACCCTTCCCGCGCGCGGGGGGTTTAATTTGAATTTGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767854.1
MSSEISTWTLFASSRRGFSRSTRTPGPDAAAVKAAASQDRSVDLNFDNDDEKTPHLKAGTAPGRNLNSYTQEKTLPARGGFNLNLDSNWEATARIDGLVGKGGDGLGFEARVLENGNGLELRGKPSFMDDDDDLNIILEEREEKGKELVEKNNNNFMIKEDKKYARAVREEFTINFVNDAAIDEMGPEQSIRGLSGRMENPSVPYIGDEWESEGTYDDLQIVLNDNNHGPMGIKRMPGMIDDDKDDKGEPLVIVVDNGDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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