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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000589`

染色体: Chr06 坐标: 5076775-5078108 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000589`
名称	SmilChr06G000589
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP28, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5076775 - 5078108 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988135`
GeneID	`130988135`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988135`
原始查询	`LOC130988135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP28, chloroplastic
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP28%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G35100` (AT5G35100) Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833461] identity=60.1; qcov=0.912; evalue=2.67e-101; confidence=high
Rice	`Os08g0292600` (OsCYP28) - identity=60.2; qcov=0.973; evalue=4.93e-125; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988135

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767890.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057767890.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057767890.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767890.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5077103`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C32
`Chr6:5077103`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C32
`Chr6:5077113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:5077138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:5077156`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,A9,B113,B129,B55,B78,B86,D9
`Chr6:5077161`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A10,A9,B113,B129,B55,B78,B86,D9
`Chr6:5077177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C73
`Chr6:5077240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,B71,C62
`Chr6:5077272`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A10,B113,B129,B78,B86,D9
`Chr6:5077325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:5077401`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr6:5077401`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767890.1

297 aa

148

297

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 94-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767890.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	94	243	6.7e-19	69.4	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911907.1
TCAAATATTAGCCCATATGATAAGAGAGAATTTAGAAAAGAAAAAAAGAAGTCCTAAAATTAGAAAATTGTGTACCCCACAACGCAACACAATCAATCTAGTTTGTGTGGCATCCAACTATCCCACATAACCAGAGTGATCACTAGCTATCTCCCTTTCCTCCAACTCCGGCCATGCAACACCACTCGCAATGGGCTGCTCCGCCACTCTCAATCTCCCTCGAAACCCCATCTCACCTCACCACCACCACCACCACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988135
ATGGGCTGCTCCGCCACTCTCAATCTCCCTCGAAACCCCATCTCACCTCACCACCACCACCACCACCACCAGCAGCAGCAGTGCCTCCCCCTGAACCGCCGGTCCCTCCTCTTCCTCTCCGGCAGCCTCCCACTCCTGACCCCCCTGAGCACCTCCGCCGCCGCCCCCGACACCACCGTGACCGACAGAGTATTCCTGGATTTCAGCATCTGCCCCTCCTACTTCCAGAGCCGCACCCTGGGCGAGTCGGACCTCTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767890.1
MGCSATLNLPRNPISPHHHHHHHQQQQCLPLNRRSLLFLSGSLPLLTPLSTSAAAPDTTVTDRVFLDFSICPSYFQSRTLGESDLSLCAESEAVGRVVVGLYGNVVPITVANFKAMCSGSAGSSYKGTLVQKLLPGQYLMAGRQGRRDKGDVKPPVELIRNTETVDSKAFVLEHSRPGVVSLCLSENDDDDDVKLSPNYHNVEFLITTGPGPCPQLDSRNIVFGSVLEGMDVVRGIAAIPTYKPGERIRQYNDLAEFLGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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