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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000591`

染色体: Chr06 坐标: 5102775-5106294 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000591`
名称	SmilChr06G000591
描述	homeobox protein knotted-1-like LET12
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5102775 - 5106294 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988137`
GeneID	`130988137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988137`
原始查询	`LOC130988137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox protein knotted-1-like LET12
产物	homeobox protein knotted-1-like LET12
Arabidopsis	`AT5G25220` (KNAT3) homeobox protein knotted-1-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832593] identity=78.1; qcov=0.8; evalue=6.69e-163; confidence=high
Rice	`Os02g0182800` (HOS58) - identity=75.1; qcov=0.737; evalue=2.87e-142; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF03789 (ELK); PF03790 (KNOX1); PF03791 (KNOX2); PF05920 (Homeobox_KN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767893.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767893.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767893.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767893.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5103434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A3,A4,B102,B118,B129,B13,B47,B54,B90,B92,C10,C13,C26,C28,C36,C47,C48,C6,C60,C7,C86,D1,D8
`Chr6:5103516`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A4,A8,B111,B127,B139,B18,B45,B53,B58,B89,C10,C72,C73,D8
`Chr6:5103604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C33
`Chr6:5103631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C63
`Chr6:5103838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767893.1

365 aa

182

365

KNOX1

KNOX2

ELK

Homeobox_KN

Homeodomain

PF03790 KNOX1 96-136 aa PF03791 KNOX2 153-201 aa PF03789 ELK 259-280 aa PF05920 Homeobox_KN 299-338 aa PF00046 Homeodomain 305-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767893.1`	Pfam	`PF03790`	KNOX1	Family	96	136	3e-18	66.0	KNOX1 domain
`XP_057767893.1`	Pfam	`PF03791`	KNOX2	Family	153	201	9.2e-16	57.8	KNOX2 domain
`XP_057767893.1`	Pfam	`PF03789`	ELK	Family	259	280	9.4e-05	22.9	ELK domain
`XP_057767893.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	299	338	9e-19	67.8	Homeobox KN domain
`XP_057767893.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	305	338	8.5e-05	23.0	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911910.1
GGCCTCATGCTCATCCCTAGAGAGATCACATTTCATGGAATGCGTAACTATTTTATAGTACTATATTTTTCATTTAACCGAACAACCAAATTTTTGTTAACCCTGCTTCCCTCCATAAAATTTTTTTTAGTAAGAATTGACACAAATTTTACGAAAAAAAAGTTATTGAGTATATTGAAAGTAAAATAAAAGATGGTTAAGTTCTAATGAGAATGATAAAAAAAATATTATAATTACAATCTAAAATAGATAGGAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988137
ATGAAGGGGGTGCAGTGCAGCAGGTCCGGAAATAGAGTTGTCCTCGTCCATAGACAAAACATGGCGTTCCAGGACCACCACGAGCTCTCCCAACAGCAAATCCCCCTTCAGCTCCCCCGCTACTCCGATCACCACCACACCTTCCCCTCGCCGGAGGACAAGCCCTCCACGTGGCTCCACCACCAGTGGCTCCCCACCCAAAGTCAACCCAGCCCCCCCGACAACAGCGATCACCGCCAGGACAGCGGCGACAGCAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767893.1
MKGVQCSRSGNRVVLVHRQNMAFQDHHELSQQQIPLQLPRYSDHHHTFPSPEDKPSTWLHHQWLPTQSQPSPPDNSDHRQDSGDSNDAAWEKERCKADILSHPLYDQLLSAHVACLRIATPVDQLPKIDAQLAQSHQMLAKYSVLGHAHQPLHDKDLDHFMTHYVLLLSSFKEQLQQHVRVHAMEAVMACWELEQSLQSLTGVAPGEGTGATMSDDDEEQADSEMNLFDESLDGTDSMGFGPLVPTESERSLMERVKQEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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