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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002915`

染色体: Chr01 坐标: 47875357-47883424 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002915`
名称	SmilChr01G002915
描述	suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47875357 - 47883424 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988153`
GeneID	`130988153`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988153`
原始查询	`LOC130988153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 2
产物	suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 2
Arabidopsis	`AT2G26460` (SMU2) RED family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817187] identity=69.6; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0146700` - identity=72.8; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF07807 (RED_C); PF07808 (RED_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988153

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767912.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057767912.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057767912.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767912.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767912.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47875906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47877805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A15,B84,C14,C61
`Chr1:47878288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:47878312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47878314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:47878467`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	87	A14,A19,A20,A21,A22,A24,A25,A4,A6,A8,B10,B100,B104,B105,B107,B108,B113,B115,B118,B12,B120,B131,B134,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B18,B20,B22,B27,B28,B29,B34,B38,B39,B42,B43,B44,B47,B48,B49,B53,B58,B6,B62,B64,B65,B7,B71,B79,B8,B85,B89,B94,B96,B98,C11,C14,C18,C20,C21,C28,C29,C30,C34,C38,C45,C46,C51,C52,C55,C57,C58,C6,C62,C63,C69,C74,C77,C8,C9,D2,D4,D9
`Chr1:47878910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B79,C22,D1
`Chr1:47878951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B67,B85,C53
`Chr1:47879484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767912.1

570 aa

285

570

RED_N

RED_C

PF07808 RED_N 8-223 aa PF07807 RED_C 447-552 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767912.1`	Pfam	`PF07808`	RED_N	Family	8	223	8.1e-83	278.3	RED-like protein N-terminal region
`XP_057767912.1`	Pfam	`PF07807`	RED_C	Family	447	552	2.6e-43	147.7	RED-like protein C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911929.1
GCGAAAGGCTGAGAGCTAACAAGCAACGAGCAACGGCCATCTCTCTCTCAGTACCAAATTGACAAATTTCCCATCCAAAAGCCCTAAACCGCGAAAATTTCATCAAATTGAATTTTCCATTTGACCGATTAATCAATCTACTCTTCGTACTTGCTGAGCGATGTCGTCGAAGCGTAATAACAAGGAGAAGACCGTCCGCCGCCACCATAAGGAGGAGAAGGCAGAAGAGCCGGAGCTGCCGAAATACAGGGACCGAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988153
ATGTCGTCGAAGCGTAATAACAAGGAGAAGACCGTCCGCCGCCACCATAAGGAGGAGAAGGCAGAAGAGCCGGAGCTGCCGAAATACAGGGACCGAGCCAAAGAACGGAGAGAAGATCAGAATCCAGATTACGAGATTACCGAGTTGACGTCCTTTCATGCCGTTGCTCCTCCGGGAACTGTTGATATCTTGTCTGCTGATGCGCACAAGTTATCTATTGAGAAGAGCAAATATCTTGGAGGTGATGTTGAGCACACCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767912.1
MSSKRNNKEKTVRRHHKEEKAEEPELPKYRDRAKERREDQNPDYEITELTSFHAVAPPGTVDILSADAHKLSIEKSKYLGGDVEHTHLVKGLDYALLNKVRSEIDKKPEAGEENEGKSKVQKDDQPVAFRTATAKSVYQWIVKPQTVIKTNEMFLPGRMAFIFNMESGFSHDIPTTVHRSKADCPVPEEMVTVSVDGSVLDRIAKIMSYLRLGSSGKVLKKKKKDKDGKGKNLSVSNGYEEDERILKSDSLKNQNDGEFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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