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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002916`

染色体: Chr01 坐标: 47880840-47883424 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002916`
名称	SmilChr01G002916
描述	uncharacterized SmilChr01G002916
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47880840 - 47883424 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988159`
GeneID	`130988159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988159`
原始查询	`LOC130988159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823398]; symbol=AT3G43230; hit=AT3G43230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/FYVE/PHD-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823398]; symbol=AT3G43230; hit=AT3G43230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G43230` (AT3G43230) RING/FYVE/PHD-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823398] identity=74; qcov=0.916; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0272400` - identity=70.6; qcov=0.869; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF01363 (FYVE); PF04366 (Ysc84)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057767925.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057767925.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767925.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057767925.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47880854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:47880961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:47881343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:47881461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:47882023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr1:47882483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D5
`Chr1:47882983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B67,B85,C53
`Chr1:47883027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A15,C14,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767925.1

474 aa

237

474

FYVE

Ysc84

PF01363 FYVE 162-227 aa PF04366 Ysc84 344-469 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767925.1`	Pfam	`PF01363`	FYVE	Domain	162	227	8.3e-21	74.6	FYVE zinc finger
`XP_057767925.1`	Pfam	`PF04366`	Ysc84	Family	344	469	1.1e-39	135.8	Las17-binding protein actin regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911942.1
ATGGCCTCAGAAGGGAAAGTTTCATATGCGTCCCTGTCTAATATGGAAAAGGAGAATACCAAGTTTTCTTATGTAGATGATTATGATGACACTCCTTGGCCACCACAAGAAGGCCAGAATGCGGAGGTGTTGAATCAGAAAGTGTCATATCCATATCCTCTCGATTCTGAAGATTTTATGGATGGAGGGTATGACTCGGGCGAGGATCAGTACCCACCTGTATCAAGAAATGGCCCACCTGAGGTGAACTTGAAAAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988159
ATGGCCTCAGAAGGGAAAGTTTCATATGCGTCCCTGTCTAATATGGAAAAGGAGAATACCAAGTTTTCTTATGTAGATGATTATGATGACACTCCTTGGCCACCACAAGAAGGCCAGAATGCGGAGGTGTTGAATCAGAAAGTGTCATATCCATATCCTCTCGATTCTGAAGATTTTATGGATGGAGGGTATGACTCGGGCGAGGATCAGTACCCACCTGTATCAAGAAATGGCCCACCTGAGGTGAACTTGAAAAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767925.1
MASEGKVSYASLSNMEKENTKFSYVDDYDDTPWPPQEGQNAEVLNQKVSYPYPLDSEDFMDGGYDSGEDQYPPVSRNGPPEVNLKNVMSGIFAILTGRNKDHSTLRNLPQLPSSNVSFLGSPKDGETVLHASVYIPSAPPLLEHNSFNYNAYKDVLEAEPPEWLPDSATTACMQCNAPFTALTRGRHHCRFCGGIFCRVCSKGRCLLPAKFRERNPQRVCDTCYDRLDPLQAVLINTISNASQIAKHDVMDWTCSRGWLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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