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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000608`

染色体: Chr06 坐标: 5246819-5251932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000608`
名称	SmilChr06G000608
描述	protein OS-9 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5246819 - 5251932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988160`
GeneID	`130988160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988160`
原始查询	`LOC130988160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OS-9 homolog
产物	protein OS-9 homolog
Arabidopsis	`AT5G35080` (OS9) ER lectin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833459] identity=57.7; qcov=0.929; evalue=3.98e-99; confidence=high
Rice	`Os06g0644800` (OsOS-9) - identity=50.4; qcov=0.913; evalue=1.41e-81; confidence=high
GO	GO:0005788 (endoplasmic reticulum lumen); GO:0030433 (GO:0030433); GO:0030968 (endoplasmic reticulum unfolded protein response); GO:0030970 (retrograde protein transport, ER to cytosol)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07915 (PRKCSH); PF13015 (PRKCSH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767922.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.80000	`XP_057767923.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057767922.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057767922.1`
5	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057767922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5247104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr6:5248661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:5249030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B32,B35,B99
`Chr6:5249060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B119,B136,B4
`Chr6:5249121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B32,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767922.1

301 aa

150

301

PRKCSH_1

PRKCSH

PF13015 PRKCSH_1 96-258 aa PF07915 PRKCSH 120-200 aa

XP_057767923.1

252 aa

126

252

PRKCSH_1

PRKCSH

PF13015 PRKCSH_1 47-209 aa PF07915 PRKCSH 71-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767922.1`	Pfam	`PF13015`	PRKCSH_1	Family	96	258	2.7e-06	27.9	Glucosidase II beta subunit-like protein
`XP_057767922.1`	Pfam	`PF07915`	PRKCSH	Family	120	200	9.8e-18	65.5	Glucosidase II beta subunit-like protein
`XP_057767923.1`	Pfam	`PF13015`	PRKCSH_1	Family	47	209	1.7e-06	28.5	Glucosidase II beta subunit-like protein
`XP_057767923.1`	Pfam	`PF07915`	PRKCSH	Family	71	151	8.5e-18	65.7	Glucosidase II beta subunit-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911939.1
CGCGCCTGAAATTTCTAAAAAATGTTGGGGGTATATTCGACTATTCATTGTATAATAACGATTCACTCATGCGCTATCAAACGCATAAACCGTGGCTGATGTGGCTGATTTTTATTGGCTTAGTCACGTGTGATTGTAAGCAGTCGAACTTCTCCGATTTCGTCCTCGGCTCTGATCACCGTCTTCGTTTGGGGGAAAAGTTAACATTAGGGCTTCAAAAGTTTCAGCTTCGGAAAGGCAAGTACCAAGACCATGAGATT...

XM_057911940.1
ATCATCACTTTCAGTTCTGATTGACATTCCATAGATGTGGGACATCTTGTGATGTCTTAAAACCATAGTTACCGGCCTAACTTGTTTGGATATCCAACCGGTGGGAAAAATATCCAATTTTGCTACTACTTGCTCAAGAGTTGACATTCTGTAGATGTGGAACATCTTGTGATGGCTTAAAACCATAGTTACCGCCTAACTTGTTTGGGTATCCAATTGGTGGGAACATATCCTGTTTTGCTACTACTTGCTCATGACTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988160
ATGAGATTTACGCGGTGCTGGATTTCCGCACTTCTTGTTTTTGTCCTCTTATGGGAGGTCGTATACTCGGATCAGACCATTTCAGCTCATACAGGTAGTAACTTTGGTCGGAGCTCTCGAGATCCGAAATTCAAAATTGAATTCCATACAGAGGACTCACCTTTCCCTCCAGATGAGGACCAAGAGTCTATTATCATGCCCAACAAGAATGGAGAAAAGTTCCTTTGCTTTTTGCCTAAAGTTCAGAAATCCAAGAGTGG...

LOC130988160
ATGGCTAATTTTCTATTTTCCCAGGATGAGGACCAAGAGTCTATTATCATGCCCAACAAGAATGGAGAAAAGTTCCTTTGCTTTTTGCCTAAAGTTCAGAAATCCAAGAGTGGGAAGCCAGTTGCTCAACAGAACTTAAGTAGCATGATTATGGAATCTGAGACGCATATGAAACTGAAGACACCAGATGAGCTTCTAGAAGTGCTGAAAGATCGGTGCTTTATTAGGCAAGAGGGATGGTGGTCATACGAGTTCTGCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767922.1
MRFTRCWISALLVFVLLWEVVYSDQTISAHTGSNFGRSSRDPKFKIEFHTEDSPFPPDEDQESIIMPNKNGEKFLCFLPKVQKSKSGKPVAQQNLSSMIMESETHMKLKTPDELLEVLKDRCFIRQEGWWSYEFCYQRRLRQIHLEDEKVVQEFFLGVYDSEATEAHNQNLSDVSILKDPRSKDASQRYHAHIFNNGTLCDLTNQPRETEVRFVCSEPRAMISSITELSTCKYALTFQCPTLCKHPLFNEERPVSHTIHC...

XP_057767923.1
MANFLFSQDEDQESIIMPNKNGEKFLCFLPKVQKSKSGKPVAQQNLSSMIMESETHMKLKTPDELLEVLKDRCFIRQEGWWSYEFCYQRRLRQIHLEDEKVVQEFFLGVYDSEATEAHNQNLSDVSILKDPRSKDASQRYHAHIFNNGTLCDLTNQPRETEVRFVCSEPRAMISSITELSTCKYALTFQCPTLCKHPLFNEERPVSHTIHCNALQKEERKAQAEDVSSRGGKITMVTDVGYSHASTPEEYAT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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