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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000611`

染色体: Chr06 坐标: 5265840-5273587 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000611`
名称	SmilChr06G000611
描述	protein S-acyltransferase 24
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5265840 - 5273587 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988162`
GeneID	`130988162`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988162`
原始查询	`LOC130988162`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S-acyltransferase 24
产物	protein S-acyltransferase 24
Arabidopsis	`AT5G20350` (TIP1) Ankyrin repeat family protein with DHHC zinc finger domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832157] identity=69.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0644500` - identity=63; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0005515 (protein binding); GO:0016409 (palmitoyltransferase activity); GO:0018345 (protein palmitoylation)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF01529 (DHHC); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988162

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endosome	内体	0.80000	`XP_057767926.1`
2	Endosome membrane	内体膜	0.80000	`XP_057767926.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057767926.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057767926.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057767926.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5266948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:5266962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B106,B119,B136,B4
`Chr6:5267028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:5267080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B106,B119,B136,B4
`Chr6:5267186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B120,C86
`Chr6:5267874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:5269420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B106,B119,B136,B4
`Chr6:5269586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:5269638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,B7,C42,C81
`Chr6:5269919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:5271174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B106,B119,B136,B4
`Chr6:5271999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767926.1

646 aa

323

646

Ank_4

Ank_2

Ank_3

Ank

Ank_4

Ank

Ank_2

Ank

DHHC

PF13637 Ank_4 40-88 aa PF12796 Ank_2 40-130 aa PF13606 Ank_3 68-96 aa PF00023 Ank 68-98 aa PF13637 Ank_4 74-121 aa PF00023 Ank 101-131 aa PF12796 Ank_2 139-225 aa PF00023 Ank 167-193 aa PF00023 Ank 201-224 aa PF01529 DHHC 373-501 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	40	88	6.3e-25	87.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	40	130	4.4e-35	120.8	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	68	96	1.1e-21	75.0	Ankyrin repeat
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	68	98	2.5e-27	94.1	Ankyrin repeat
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	74	121	6.3e-25	87.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	101	131	2.5e-27	94.1	Ankyrin repeat
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	139	225	4.4e-35	120.8	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	167	193	2.5e-27	94.1	Ankyrin repeat
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	201	224	2.5e-27	94.1	Ankyrin repeat
`XP_057767926.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	373	501	9.9e-32	110.5	DHHC palmitoyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911943.1
AATAATTTAGCGAATAATTTCGACGTTTCTCAATCTCATCCCATCCAGTCAACTCCCTATCTCCTTGTCCTTCCGAGAAAACCCCTAAGAATTGGTCAAACATTCAAAATACATCCCTATATACCAACCAGATTTATACATCACCTATACACGCCATTGTTGATCATCAATTCGAATCCTCCCTGATTGATCTCCGCGCGTCCCATCCATATTCTCGGAAATTTGTATTATGGCGTCGGAGATCGAAGTTGTGGAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988162
ATGGCGTCGGAGATCGAAGTTGTGGAGGAGGTGGAATCGAGGGATCATCGGCCGGACTCCTCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCCGGAGGACGAGAGCTTGAGGAACGATGTTTACACGGCCGCTGCCTACGGGGATATGGAGAAGCTCCAGAGGCTAGTGGAGAGTGAGGGTTGCTCCGTTTCGGAGCCCGACGCCCTCGGCTACTATGCCCTCCAATGGGCAGCGCTTAATAATCGAACGGCCGCAGCTCAGTACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767926.1
MASEIEVVEEVESRDHRPDSSAAAAAAAPEDESLRNDVYTAAAYGDMEKLQRLVESEGCSVSEPDALGYYALQWAALNNRTAAAQYIIEHGGDINARDHTGQTAMHWSAVRGAIPVAELLLQEGARVSAADFNGYQTTHVAAQYGQTAFLCHIVTKWNADADVPDNDGRSPLHWAAYKGFADCIRLLLYLNAHRVRQDKEGCTPLHWAAIRGNLEACTVLVMAGKKEDLMVTENTGLTPAQLAADKNHRQVAFFLGNARR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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