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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000613`

染色体: Chr06 坐标: 5282335-5285461 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000613`
名称	SmilChr06G000613
描述	uncharacterized SmilChr06G000613
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5282335 - 5285461 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988163`
GeneID	`130988163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988163`
原始查询	`LOC130988163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homogentisate prenyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007993]; symbol=HST; hit=AT3G11945; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	homogentisate prenyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007993]; symbol=HST; hit=AT3G11945; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G11945` (HST) homogentisate prenyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007993] identity=52.4; qcov=0.235; evalue=1.32e-08; confidence=weak
Rice	`Os07g0576000` (HPT2) - identity=50; qcov=0.235; evalue=2.14e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767927.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057767928.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057767928.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057767927.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5282553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B90,B92,C21
`Chr6:5282553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C21
`Chr6:5282568`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A11,A13,A21,A23,B109,B111,B140,B15,B22,B27,B63,B78,B81,B97,C12,C15,C18,C21,C25,C36,C47,C5,C54,C62,C79,C85,D1
`Chr6:5282604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr6:5282637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A2,B4,B61,B90,B92,B95,C21,C24,C31,C35,C76,D4,D9
`Chr6:5282641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:5282682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B12,B51,B64,C6
`Chr6:5282683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B46,B64
`Chr6:5282957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:5282993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C24,C31
`Chr6:5283020`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B115,C42
`Chr6:5283020`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B115,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089993.1
TTGTGTATTAAAACTCCTTATTACATAAACTAATACTTTTATCAAATTACTGCTCCTCCCTTTGCTCCCATCCGCCGCCGCAGCCTGTCATCCCCGACTGTCGCCCGCCACCGCCCGATACCCCCGCTGCCGTCGCCTCCTCATCAGCTCGGCGCCTCCATGATTCTCCTTCTCTCTTCTTCGACGAACAGCTGCTCGACGAGTGCTCGCCTCAAACAGCCGCACCCGCACAGGCACACACAAGCGAGCGCGCCTCCATC...

XR_009089994.1
TGTGTATTAAAACTCCTTATTACATAAACTAATACTTTTATCAAATTACTGCTCCTCCCTTTGCTCCCATCCGCCGCCGCAGCCTGTCATCCCCGACTGTCGCCCGCCACCGCCCGATACCCCCGCTGCCGTCGCCTCCTCATCAGCTCGGCGCCTCCATGATTCTCCTTCTCTCTTCTTCGACGAACAGCTGCTCGACGAGTGCTCGCCTCAAACAGCCGCACCCGCACAGGCACACACAAGCGAGCGCGCCTCCATCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988163
ATGATTCTCCTTCTCTCTTCTTCGACGAACAGCTGCTCGACGAGTGCTCGCCTCAAACAGCCGCACCCGCACAGGCACACACAAGCGAGCGCGCCTCCATCGTCGCTCGCCGTCCGCCACCATCGATGTCAGCATCAGCAGCAAGCGCTATCGCCACCTCTGTCACCTCCATCCAACGGCAGTCACCGGCCCAGCCAGAGGTTTCTGATTGATACTTTGGAAACAAAGCTTGGTCTGAGAAATATGGCATTGCTTGGAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767927.1
MILLLSSSTNSCSTSARLKQPHPHRHTQASAPPSSLAVRHHRCQHQQQALSPPLSPPSNGSHRPSQRFLIDTLETKLGLRNMALLGTRLLLINYIGSVAVAIYLPQKKSVGSSLMLGVESQWAPIALRCMNGHVGFMLSCYDAQLSYGSTSDNFVAKYKNLLYKNLLSKSIYIHLLCTLAVHGSIEWC

XP_057767928.1
MILLLSSSTNSCSTSARLKQPHPHRHTQASAPPSSLAVRHHRCQHQQQALSPPLSPPSNGSHRPSQRFLIDTLETKLGLRNMALLGTRLLLINYIGSVAVAIYLPQKKSVGSSLMLGVESQWAPIALRCMNGHVGFMLSCYDAQLSYGSTSDNFVAKYKNLLYKNLLSTLAVHGSIEWC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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