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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000622`

染色体: Chr06 坐标: 5472554-5475666 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000622`
名称	SmilChr06G000622
描述	putative serine/threonine-protein kinase
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5472554 - 5475666 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988171`
GeneID	`130988171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988171`
原始查询	`LOC130988171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative serine/threonine-protein kinase
产物	putative serine/threonine-protein kinase
Arabidopsis	`AT1G79620` (AT1G79620) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844301] identity=44.1; qcov=0.546; evalue=1.22e-38; confidence=medium
Rice	`Os01g0816600` - identity=45.6; qcov=0.542; evalue=4.42e-41; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767935.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767935.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767935.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767935.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5472799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:5472879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B114,B140,C82
`Chr6:5473518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767935.1

372 aa

186

372

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-294 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 24-296 aa

XP_057767936.1

369 aa

184

369

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-291 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 24-293 aa

XP_057767937.1

295 aa

148

295

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-158 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 24-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767935.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	294	2e-36	126.5	Protein kinase domain
`XP_057767935.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	24	296	1.5e-37	130.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057767936.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	291	9.2e-37	127.6	Protein kinase domain
`XP_057767936.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	24	293	2.4e-38	132.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057767937.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	158	2.2e-21	77.2	Protein kinase domain
`XP_057767937.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	24	161	7.8e-25	88.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911953.1
ATCTAATACTTTATACACACCCTATAGAATAAGAATACATATTATATATTAATGGAAATTTCAGTAATTCGTTGGAAATGCGTAATCTTTCTAATAATTGATCTGAACGGTTTTCCACATTTTTTATATAGACCTGAACGGTGTTATACTATTAACAATTATTACTATGACATAACAAAATACACAATATAACGAAACATAAATAAAATGGCTTTTCGTATGGAACGCACTTTCAGAGAAATTAACTTCCTCTGCACATT...

XM_057911954.1
ATCTAATACTTTATACACACCCTATAGAATAAGAATACATATTATATATTAATGGAAATTTCAGTAATTCGTTGGAAATGCGTAATCTTTCTAATAATTGATCTGAACGGTTTTCCACATTTTTTATATAGACCTGAACGGTGTTATACTATTAACAATTATTACTATGACATAACAAAATACACAATATAACGAAACATAAATAAAATGGCTTTTCGTATGGAACGCACTTTCAGAGAAATTAACTTCCTCTGCACATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988171
ATGAAGTTAAGGCGATTTCGTTTGGAAGAACTGCAGAAGGCCACAGACAATTTCAGCCATGATTTCTTGATTGGTCATGGATCATTTGCTAACGTCTATCGCGGTACATTCCCTGTGGAGGGAACTCTAGCAATCAAGAAGCCTCATTCTGAAGCATACACAAGCACTGAAGACTTCAGAAATGAAGTGAGGTTGCTGTCAAAAGTGAAGCATGAGAATCTGGTTGCATTGGTGGGATTCTGTGAAGAAACAGGGCCAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767935.1
MKLRRFRLEELQKATDNFSHDFLIGHGSFANVYRGTFPVEGTLAIKKPHSEAYTSTEDFRNEVRLLSKVKHENLVALVGFCEETGKKGPKAAKILVYEYVANGSLLDYIIGKGGRSLTWRERVKIAIGAAKGIGHLHEGIRPSIIHRDLKPSNILVGEGFEAKVSDFGLVRTGPVGDESHVTSKVKGTLGYLDPAYCSTFHLTPFTDVYSFGVILLQLLTARPALDSTRAANSTSHIINWARLSIEKGKIGDILDTNLLV...

XP_057767936.1
MKLRRFRLEELQKATDNFSHDFLIGHGSFANVYRGTFPVEGTLAIKKPHSEAYTSTEDFRNEVRLLSKVKHENLVALVGFCEETGPKAAKILVYEYVANGSLLDYIIGKGGRSLTWRERVKIAIGAAKGIGHLHEGIRPSIIHRDLKPSNILVGEGFEAKVSDFGLVRTGPVGDESHVTSKVKGTLGYLDPAYCSTFHLTPFTDVYSFGVILLQLLTARPALDSTRAANSTSHIINWARLSIEKGKIGDILDTNLLVQGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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