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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000644`

染色体: Chr06 坐标: 5700935-5704169 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000644`
名称	SmilChr06G000644
描述	protein SRG1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5700935 - 5704169 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988189`
GeneID	`130988189`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988189`
原始查询	`LOC130988189`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SRG1-like
产物	protein SRG1-like
Arabidopsis	`AT5G20400` (AT5G20400) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832162] identity=50.9; qcov=0.961; evalue=1.07e-127; confidence=high
Rice	`Os02g0280700` (HIS1) - identity=45.2; qcov=0.963; evalue=4.79e-104; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988189

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767954.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767954.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767954.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767954.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5701285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr6:5701826`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B126,B78,B79,C31
`Chr6:5701826`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B126,B78,B79,C31
`Chr6:5703229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:5703287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B71,B72,C62
`Chr6:5703709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:5703765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B57,B74
`Chr6:5703793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767954.1

356 aa

178

356

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 58-163 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 214-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767954.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	58	163	6.8e-26	91.9	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057767954.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	214	309	4.1e-31	108.0	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911971.1
AACAGAAGAGTCAATTAAAAAAGAATGTTATTATTTGAGGCAAGAAAATATGTTGCTGATGACGACTTTCGTATATACCCCATTCAAATCCCAAGCAAGCTTCTCTGTTTTCTCTCATCTCTAGAATGAATACTAATACCATGGCTGAAGTCTCTCCCTCCATAAAACCAGAGGCGGCCTGCTGCTCAACTGTTGAAGAATTGATTAACAATGGCGATGAGCTCCCGCAGAGGTATATCTGGACCGATAGTGGTAAGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988189
ATGAATACTAATACCATGGCTGAAGTCTCTCCCTCCATAAAACCAGAGGCGGCCTGCTGCTCAACTGTTGAAGAATTGATTAACAATGGCGATGAGCTCCCGCAGAGGTATATCTGGACCGATAGTGGTAAGTATGGGCCGATTGATCTTACTGTTCCTTTGGCTACCGACATTCCTGTCATTGACCTCTCCCGCTTGTCCAATGCGGCGGAGCTGCTCCGCCTCCGCTCCGCTCTCACTTCATGGGGCTGTTTCCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767954.1
MNTNTMAEVSPSIKPEAACCSTVEELINNGDELPQRYIWTDSGKYGPIDLTVPLATDIPVIDLSRLSNAAELLRLRSALTSWGCFQAVNHGIDDLFLDEVRQLARDFFELPMTEKHKYARRGDGYEGYGNDLVLFDNQPLDWSDRLYLQVAPDHHQKLQYWPQNPESFRKVLHDYTAKLKQIGEQLLKSMEKLLSLPEGSFLNKFGEQQMMYARFNYYPPCSKPDQVLGLKPHADGSAMTILLQDRDVRGLQLLKDNQWF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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