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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000645`

染色体: Chr06 坐标: 5706213-5727102 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000645`
名称	SmilChr06G000645
描述	jasmonate-induced oxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5706213 - 5727102 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988190`
GeneID	`130988190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988190`
原始查询	`LOC130988190`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	jasmonate-induced oxygenase 2-like
产物	jasmonate-induced oxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT1G49390` (AT1G49390) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841362] identity=44.8; qcov=0.933; evalue=3.29e-90; confidence=medium
Rice	`Os06g0176700` (OsHSL1) - identity=39.9; qcov=0.964; evalue=2.41e-74; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767955.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767955.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767955.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767955.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767955.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5725521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr6:5725601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr6:5725631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D6
`Chr6:5725978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B132
`Chr6:5725998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B110,B15,B22,B62,C41,C84,D7
`Chr6:5726411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B2,B56,B96,C20
`Chr6:5726418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B37,B74
`Chr6:5726438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr6:5726460`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A25,A6,A7,B11,B111,B117,B121,B34,B41,B42,B47,B53,B58,B60,B65,B70,B73,B89,C3,C43,C49,C5,C51,C74
`Chr6:5726748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr6:5726772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C58
`Chr6:5726916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767955.1

330 aa

165

330

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 32-138 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 187-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767955.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	32	138	2.2e-23	83.9	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057767955.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	187	283	8.5e-32	110.2	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911972.1
ACCAGCATAGATGAATCTTCAGTCTTCATCCCTTCCATAGTTCCATTTGCATACAAAACCTTTTATACATCTCTTCTTATGGCCGGAGAATCTTATCACTTGGGATTTCAAAGTGAAATTGACAAGGATGAGCAGCGAAGCATACCACTCACTGTTCCTTTGGCTACAGAAATTCCGGTCATCGACCTCCGCCGATTGCTTGCCGCCTCCACCGATGCCGACCTCTCTGACCTCCGCTCCGCTCTCAGCTCCTGGGGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988190
ATGGCCGGAGAATCTTATCACTTGGGATTTCAAAGTGAAATTGACAAGGATGAGCAGCGAAGCATACCACTCACTGTTCCTTTGGCTACAGAAATTCCGGTCATCGACCTCCGCCGATTGCTTGCCGCCTCCACCGATGCCGACCTCTCTGACCTCCGCTCCGCTCTCAGCTCCTGGGGTTGCTTTCAGGTAGTAAATCATGGCATTGAAAGCTCTCTACTAGATGAGGTGCGCAGCATCAGCAGAGAATTCTTTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767955.1
MAGESYHLGFQSEIDKDEQRSIPLTVPLATEIPVIDLRRLLAASTDADLSDLRSALSSWGCFQVVNHGIESSLLDEVRSISREFFQLPMSEKQIYAGEEEGYKIDQLVTDDQFPDWSHNLRLRIFPEDRRKPKYWPQNPDSFRKVVVEYGDKLRGVAEEILKLTGKSLKLGDEESFVKKTSGMYAQFNYYPPCPNPDRVLGLRQHSDFSMITILLQDDQVQGLQLLKDDNWFAAPTMPHALLVFAGDQLQIMSNGILKSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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