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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002920`

染色体: Chr01 坐标: 47970777-47972853 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002920`
名称	SmilChr01G002920
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47970777 - 47972853 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988193`
GeneID	`130988193`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988193`
原始查询	`LOC130988193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT1G53840` (PME1) pectin methylesterase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841821] identity=42.3; qcov=1.08; evalue=1.76e-153; confidence=medium
Rice	`Os09g0433700` (OsPME27) - identity=34.3; qcov=1.13; evalue=7.12e-123; confidence=low
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988193

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057767959.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057767959.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767959.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767959.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47971261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:47971537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A25,B129,C25
`Chr1:47971576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47971668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:47971893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:47972028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:47972158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C25
`Chr1:47972196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C70,C85,C87
`Chr1:47972208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C70,C85,C87
`Chr1:47972211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B131,B64,C22,C9
`Chr1:47972232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:47972312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B19,B67,B85,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767959.1

538 aa

269

538

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 57-201 aa PF01095 Pectinesterase 231-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767959.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	57	201	6.3e-25	88.8	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057767959.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	231	524	6.8e-131	436.2	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911976.1
TCAGTAAATGACAAGAAATATATATTTACAATATATGTGATCTTAATTAATTAAAAGTGAGAAAACTAACTCCACAACAACACTTGATTGATTGTCATTTGGCATAAATTAAAACACTCATCGCCTGCAGCCGCTACAACGACACAGCTGCAGCAGACTTGTTCAGTATATAAGAATTTCCCGATTCGGCCTTACTAAATCTGGATTTAATTAAAAGTCGTCTAAGAAAATTAAATATATATCAAAAGTCATGGAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988193
ATGGAGAAAACAGATTCTTTCAAGAGACAGGAGGAGGAGTACCGGAGAAAGACGCGGCGGCGCTTCATCATCATCGCCCTATCCTCCGTCTTGCTGCTGCTACTCGTGATCGGATCCGTAGTCGTTCCGGTCACAAACAGCGCCTCGTCTTCCTCCAATGAGAAGCAGTCGATCGAGTCGGTGTGCAACGTGACATTGTATCAAGAATCCTGCTATTCCAGCATCTTCGCCCTCAAACAATCCACCAAGACCTCCAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767959.1
MEKTDSFKRQEEEYRRKTRRRFIIIALSSVLLLLLVIGSVVVPVTNSASSSSNEKQSIESVCNVTLYQESCYSSIFALKQSTKTSNSNPDTPKQIFMLSLQVALNELTALKSSTFRGNGSTYKALDVCSRLVEDAADHVNMSASSLSNSDSIHWAEDVRTWLSTAITDQQTCLEALTNESATEIRASMANAAVFTSNSLAIVSKIPALIQGRRNKRAVQSVGVEMADLRPNLTVAKDGSGNYKTITEAVNAMPKRSKRRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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