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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000648`

染色体: Chr06 坐标: 5735768-5737611 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000648`
名称	SmilChr06G000648
描述	uncharacterized SmilChr06G000648
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5735768 - 5737611 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988194`
GeneID	`130988194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988194`
原始查询	`LOC130988194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Y-family DNA polymerase H [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834503]; symbol=POLH; hit=AT5G44740; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Y-family DNA polymerase H [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834503]; symbol=POLH; hit=AT5G44740; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G44740` (POLH) Y-family DNA polymerase H [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834503] identity=61.5; qcov=0.504; evalue=1.77e-16; confidence=low
Rice	`Os01g0757800` (XPV) - identity=49.2; qcov=0.488; evalue=1.57e-10; confidence=low
GO	GO:0003684 (damaged DNA binding); GO:0003887 (DNA-directed DNA polymerase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005657 (replication fork); GO:0009314 (response to radiation); GO:0035861 (site of double-strand break); GO:0042276 (error-prone translesion synthesis)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767957.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057767957.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057767957.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767957.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5736256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B28,B37,B41,B54
`Chr6:5736273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C32,C47,C68
`Chr6:5736274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B37,B54
`Chr6:5736313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B31,C28
`Chr6:5736314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:5736317`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B95
`Chr6:5736317`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B95
`Chr6:5736824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C5
`Chr6:5736831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B90,B92,C31,C73
`Chr6:5736843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A21,C57
`Chr6:5736843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C57
`Chr6:5736858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090004.1
AAACACATCTAAGAAAAAATTGTCTTTTCATATTTCTCCCTAAAAATTGTTGGTCAAGACTTTTCATTTCTCCAATTTTGTTTTTTCAGTTTTTACGCAACATATTCTTCTTTTCTTCCTTCTCATCTTCTTAGCATATTCTTCTGTTTCTCTCACCATATTCTTATGTTCTTCAGACTTCTCAACATATTCTTCTGTTCTTCCGACGCAGTTTGCGATTTCTCCATCTTCCGGTTTAACCTCCGTCGCCTTCCTTCTTT...

XM_057911974.1
GTAGTTTCTCAAAACTTTCCCGCCTAAACACATCTAAGAAAAAATTGTCTTTTCATATTTCTCCCTAAAAATTGTTGGTCAAGACTTTTCATTTCTCCAATTTTGTTTTTTCAGTTTTTACGCAACATATTCTTCTTTTCTTCCTTCTCATCTTCTTAGCATATTCTTCTGTTTCTCTCACCATATTCTTATGTTCTTCAGACTTCTCAACATATTCTTCTGTTCTTCCGACGCAGTTTGCGATTTCTCCATCTTCCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988194
ATGAGAGGAGATGACTTCTCCTTCGCCGAAGAGAAAATCAGAAACGTCGACAACAACTCCTCTGGGGCAAATAAAAGGGACACATCTCTGTCTACTGTTCAGAAGTGGCTGAATGAACTTTGTTCTGAACTGCGTGAACGTCTTCTTCGTGATCTGGAACAGAATAAACGCATTGCTCGGTCTCTTACCCTTCATGCAAGTGCTTACAAGTTGATTGACTCAGAATCAGTCAAAAAGTTCCTTAAGGTATGGGATTGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767957.1
MRGDDFSFAEEKIRNVDNNSSGANKRDTSLSTVQKWLNELCSELRERLLRDLEQNKRIARSLTLHASAYKLIDSESVKKFLKVWDCQDSRRCPQPISCWAAWICWGIPCEDERNQASCVGNNRSLCLSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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