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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002921`

染色体: Chr01 坐标: 48000193-48000921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002921`
名称	SmilChr01G002921
描述	putative lipid-binding protein AIR1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48000193 - 48000921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988202`
GeneID	`130988202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988202`
原始查询	`LOC130988202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative lipid-binding protein AIR1
产物	putative lipid-binding protein AIR1
Arabidopsis	`AT1G62510` (AT1G62510) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842548] identity=63.2; qcov=0.707; evalue=7.39e-34; confidence=medium
Rice	`Os02g0662000` (RCc3) - identity=65.5; qcov=0.707; evalue=4.51e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2); PF14547 (Hydrophob_seed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057767971.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767971.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767971.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767971.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48000367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B98,C48
`Chr1:48000374`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A1,B105,B115,B119,B75,B97,C38,C50
`Chr1:48000378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:48000401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:48000507`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr1:48000507`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr1:48000542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767971.1

123 aa

123

LTP_2

Hydrophob_seed

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 33-123 aa PF14547 Hydrophob_seed 40-123 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 41-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767971.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	33	123	6.5e-08	33.3	Probable lipid transfer
`XP_057767971.1`	Pfam	`PF14547`	Hydrophob_seed	Domain	40	123	3.4e-23	82.5	Hydrophobic seed protein
`XP_057767971.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	41	123	4.1e-16	59.7	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911988.1
CACTCGTCTGCTTTTCTTAAATTAATTAACAATATCAACTCTTGAAATAAGAAAGTAAAAGAAAAAACAAAGTTATATAGAATATGGCTTCACCAAAAGCCCGTATCCTTGTCTCCCTCAACCTCGTCTACTTGGTTCTATCCGCCACCACCACCACCACCGGAGGCAGCGGGTCGGCGATGCCCCCCCGGGCGATGCCAAGGTGCCCGAGAGACGCCCTAAAGCTAGGTGTATGCGCAAAAGTGGTGGGGAATTTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988202
ATGGCTTCACCAAAAGCCCGTATCCTTGTCTCCCTCAACCTCGTCTACTTGGTTCTATCCGCCACCACCACCACCACCGGAGGCAGCGGGTCGGCGATGCCCCCCCGGGCGATGCCAAGGTGCCCGAGAGACGCCCTAAAGCTAGGTGTATGCGCAAAAGTGGTGGGGAATTTGGTGGGAGTGTGGGCTGGGAAACCTCCGATCAGGCAGTGCTGCAGCTTGGTCGAGGGGCTGGTGGAGCTGGAGGCGGCGGTGTGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767971.1
MASPKARILVSLNLVYLVLSATTTTTGGSGSAMPPRAMPRCPRDALKLGVCAKVVGNLVGVWAGKPPIRQCCSLVEGLVELEAAVCLCTAIRANVLGINLNIPLSLTLLLNACGTTPPIDFTC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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