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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000661`

染色体: Chr06 坐标: 5807197-5812546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000661`
名称	SmilChr06G000661
描述	peptide chain release factor APG3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5807197 - 5812546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988206`
GeneID	`130988206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988206`
原始查询	`LOC130988206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide chain release factor APG3, chloroplastic-like
产物	peptide chain release factor APG3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G62910` (APG3) Peptide chain release factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825466] identity=79.9; qcov=0.893; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0657100` - identity=80.7; qcov=0.893; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006415 (translational termination); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0010027 (thylakoid membrane organization); GO:0016149 (translation release factor activity, codon specific); GO:0032544 (plastid translation)
KEGG	-
Pfam	PF00472 (RF-1); PF03462 (PCRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767977.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057767977.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767977.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767977.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767977.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5807692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:5807735`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B128,B133,B87,C11,C21,C69,C76
`Chr6:5808047`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A23,C84,D10,D11
`Chr6:5808047`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A23,C84,D10,D11
`Chr6:5808706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C49,C9
`Chr6:5808706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C9
`Chr6:5809657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:5809681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B101,B16,B83,C35,C59,C64,C66,C81
`Chr6:5809710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:5809719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B93,B96
`Chr6:5809741`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A11,A14,A2,A22,A25,A3,A6,A7,A9,B11,B111,B117,B121,B122,B125,B140,B3,B34,B41,B42,B43,B47,B53,B58,B59,B60,B65,B70,B73,B89,B90,B92,C2,C24,C3,C32,C35,C42,C43,C49,C5,C51,C68,C74,C82,C83,C86,C87,D3,D6
`Chr6:5809876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767977.1

412 aa

206

412

PCRF

RF-1

PF03462 PCRF 61-252 aa PF00472 RF-1 259-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767977.1`	Pfam	`PF03462`	PCRF	Domain	61	252	1.8e-71	240.7	PCRF domain
`XP_057767977.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	259	369	2.1e-37	128.3	RF-1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911994.1
CGATTTATTCTTTAATAGTAGTATATAGTACGGAAAATATAAAAGATTGTGAAAATATTCATTCGCGCGTTTTATCCAATTATCCTAAACTCAGCCGCTAGCACGATGACCAGTTTAACGGCGAGCTTCGCCGCTCGTTTCTCCTCCGCCACCGCACATTTGCCGGCGGGGAGTCGCGTTCCGCGGCGTGCGTTCTTCCTGCAGCCTCCGACCCGACGCTGTCGTTCGGGAAGAATAGTGTGCTCGGCGGAACCATATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988206
ATGACCAGTTTAACGGCGAGCTTCGCCGCTCGTTTCTCCTCCGCCACCGCACATTTGCCGGCGGGGAGTCGCGTTCCGCGGCGTGCGTTCTTCCTGCAGCCTCCGACCCGACGCTGTCGTTCGGGAAGAATAGTGTGCTCGGCGGAACCATATTTAATATCGAAATTAGAGTCCGCGTGGAAGGAATTATCGGTTAGACTGGCTGATCCAGATGTAGCCTCAAATCCAAGTGAGTATCAGAAATTAGCACAATCTTTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767977.1
MTSLTASFAARFSSATAHLPAGSRVPRRAFFLQPPTRRCRSGRIVCSAEPYLISKLESAXWKELSVRLADPDVASNPSEYQKLAQSLAELDEVVETFRSFKDCQKQLEEAKALAKEAGNDEDMVEMINSEIASLANQIKELEERLKLLLLPTDPLDARNILLEVRAGTGGDEAGLWAGDLVRMYEKYSERNSWKFSPVSSSEAEYGGYKTYVMEIKGKRVYSKLKYESGVHRVQRVPRTETQGRVHTSTATVAIMPEADE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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