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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000664`

染色体: Chr06 坐标: 5837541-5839097 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000664`
名称	SmilChr06G000664
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5837541 - 5839097 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988210`
GeneID	`130988210`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988210`
原始查询	`LOC130988210`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
产物	pelargonidin 3-O-(6-caffeoylglucoside) 5-O-(6-O-malonylglucoside) 4'''-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=30.5; qcov=1.03; evalue=2.38e-60; confidence=low
Rice	`Os04g0500700` (OsHCT1) hydroxycinnamoyltransferase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4336306] identity=26.6; qcov=0.916; evalue=3.09e-30; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988210

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767979.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767979.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057767979.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767979.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5837805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr6:5837819`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A1,A13,A22,B11,B122,B123,B128,B37,B54,B6,C21,C50,C67,C69
`Chr6:5837831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C46
`Chr6:5837887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C21,C69
`Chr6:5837927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:5837991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:5838246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr6:5838336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:5838395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B1,B13,C28
`Chr6:5838468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:5838520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B77,C27
`Chr6:5838537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B77,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767979.1

430 aa

215

430

Transferase

PF02458 Transferase 1-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767979.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	419	1.3e-66	225.8	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911996.1
TGAAACAACCACATACTTTTTTATTCACTAATTAATTAAACGCATCAATCATGTTTTCCAATATAACCGAAACGAGACGAGTGCATTTGGCGTAACACAAATTAGCATTGATCAAGATGAAGATAAACTTAATTAGCAGGAAGCTAATCAAACCTACCACCCAAACTCCTCAACACCTCAACCAATACAGCATCTCCTTCACCGATGAGTTCTCCCCGCCCATGAACGTTCGCATCCTTCTCTTCTACACCTCCGCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988210
ATGAAGATAAACTTAATTAGCAGGAAGCTAATCAAACCTACCACCCAAACTCCTCAACACCTCAACCAATACAGCATCTCCTTCACCGATGAGTTCTCCCCGCCCATGAACGTTCGCATCCTTCTCTTCTACACCTCCGCATCCAAACGAATCCGCCGTCTCGAAGAATCGCTCGGAGAAATTCTGCCGCGATTCTACCCTCTCGCCGGAAGATACATCAAGACCGATCACGTGGTCGACTGCAGCGACGAGGGAGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767979.1
MKINLISRKLIKPTTQTPQHLNQYSISFTDEFSPPMNVRILLFYTSASKRIRRLEESLGEILPRFYPLAGRYIKTDHVVDCSDEGAEFIEAEATDVESMDLIRAMEPDQLNHLFSRQFYQLDESAACPLLSVQATRFKCGGLAVGIGIAHRIFDGSSLETFVQAWSDHSAAGETAITPSFDSPSLLPRGDLDCTPTTDKSEMKNISICTKRFLFTAEAITRLRYELRREESDPYITRVRAACALIAKALIDLDRARHGQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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