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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000682`

染色体: Chr06 坐标: 6035134-6042801 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000682`
名称	SmilChr06G000682
描述	synaptotagmin-5
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6035134 - 6042801 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988229`
GeneID	`130988229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988229`
原始查询	`LOC130988229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	synaptotagmin-5
产物	synaptotagmin-5
Arabidopsis	`AT1G05500` (NTMC2T2.1) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837052] identity=75; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0251600` (OsNTMC2T4.2) - identity=40.9; qcov=0.701; evalue=9.02e-96; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF17047 (SMP_LBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767998.1`
2	Endosome	内体	0.20000	`XP_057767998.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767998.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767998.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6036836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:6038095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr6:6038643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B61,B74
`Chr6:6040050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:6041825`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr6:6041825`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr6:6042034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B1,C79
`Chr6:6042152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C12
`Chr6:6042156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6042162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:6042240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:6042247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767998.1

565 aa

282

565

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 70-248 aa PF00168 C2 262-366 aa PF00168 C2 441-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767998.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	70	248	2.8e-14	53.7	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057767998.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	262	366	8e-55	184.2	C2 domain
`XP_057767998.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	441	541	8e-55	184.2	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912015.1
GGATAAGTATATAAATGTCAGCTAGTGTATGTACATATATGATGGGTTCACTGTTCACAGCTGGTAATAAATGATTTGCTCATACAATTGGCTGTTTGGCCGACCTTTATAGCATTGATTACAACGGCGGAATTAGAAGCGGTAAACCTACTGTAATCACAAATCACACGCACTAATCCGCCATTAATCCACTTTGACGACTATCAGAATCAAGTCCACATCCACACTCTCACTCTCTCACTTCCATTTCTAGCACAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988229
ATGTCGTTTGTGGCTGGTTTGGTGATCGGATTGGTCGTCGGCTTAGCGCTCATTGTTGCTTTCGTCCGCTCCGAAAATGCCCGATCCAAGCACCGCTCCGACCTCGCTGCTACGGTTACGTCGTTTGCGAGAATGACGGTGGAGGATTCGAGGAAGTTGTTGTCACCGGAGTTCTATCCTTCCTGGGTGGTGTTTTCGCAGCGCCAGAAGTTGACTTGGCTTAATGTTCACCTCGAAAAGATTTGGCCATACGTGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767998.1
MSFVAGLVIGLVVGLALIVAFVRSENARSKHRSDLAATVTSFARMTVEDSRKLLSPEFYPSWVVFSQRQKLTWLNVHLEKIWPYVNEAASELIKANVEPVLERYRPVILASLTFSKFTLGTVAPQFTGVSIIDDGCEGITMELEMQWDGNPSIVLDIKTYLGVGLPVQVKNIGFTGVFRLIFRPLVDEIPCFGAVCFSLRHKKKLDFTLKVVGGDISTIPGLSDAIEGTIRDAVEDSITWPVRKVIPILPGDYSDLELKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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