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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000700`

染色体: Chr06 坐标: 6249817-6256374 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000700`
名称	SmilChr06G000700
描述	uncharacterized SmilChr06G000700
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6249817 - 6256374 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988248`
GeneID	`130988248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988248`
原始查询	`LOC130988248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0173000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0173000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0173000` - identity=29.6; qcov=1.04; evalue=7.4e-124; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF12231 (Rif1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768027.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057768027.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768027.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768027.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768027.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6250031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C74
`Chr6:6250325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:6250938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C40
`Chr6:6251908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B88,C28
`Chr6:6252429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6252806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B3,B90,B92,C83
`Chr6:6253372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B99
`Chr6:6253519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr6:6253939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:6253950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6254098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C24
`Chr6:6254165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768027.1

1079 aa

540

1079

Rif1_N

PF12231 Rif1_N 18-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768027.1`	Pfam	`PF12231`	Rif1_N	Repeat	18	361	9.5e-31	107.8	Rap1-interacting factor 1 N terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912044.1
CAACTCGACGTATGTGTATAGTGTATGCTTAAGAAGACAATTTTCCCTCCCAAAATATGGCGCGAATGTCACAGTGCTGGGACTTGCTGAATTAGGGCTTCCAAATCCAAGTACCAAGAATCTATCCAATCTATCAAGAAATGGGGGATTTCAGAAAGCAGATTGATGAAATTCACGCCCTTTTACTATCAGATGACAAAGCTCGAGCATACTCCAAACTACTGCAATTGCAGGAAATATCGACCGTTGATTCTTCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988248
ATGGGGGATTTCAGAAAGCAGATTGATGAAATTCACGCCCTTTTACTATCAGATGACAAAGCTCGAGCATACTCCAAACTACTGCAATTGCAGGAAATATCGACCGTTGATTCTTCCGCCGTAGAGACACTCGCCGGTTCATCTAGCACCATCCTATCCTTCCTCGTCGCGGACATATCCTATACTGATGAAGAAATAGCTGCGCAGGCCTTGAAGTGCTTGGGTTTCATGATTTACCACCCTGCTGTTGTGGCTTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768027.1
MGDFRKQIDEIHALLLSDDKARAYSKLLQLQEISTVDSSAVETLAGSSSTILSFLVADISYTDEEIAAQALKCLGFMIYHPAVVASIGGHDADVLIESLVKVIATTKIKSVCNLGVWCISIQQLSSSMLEQHFHSLLRAVTHALDNPIGSLSITFEAMQAVVKLVSSLTEQMRGTSSLWTPPIYRRLVSLDKRDRDMSERCLLKIMSSIFPPPVTLSKVLAVDMKKKLLGSMKELLGKGMKIHCLQAWRWFIRLLGPYAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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