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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002930`

染色体: Chr01 坐标: 48082383-48087411 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002930`
名称	SmilChr01G002930
描述	coniferyl alcohol acyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48082383 - 48087411 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988250`
GeneID	`130988250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988250`
原始查询	`LOC130988250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coniferyl alcohol acyltransferase-like
产物	coniferyl alcohol acyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G78990` (AT1G78990) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844239] identity=51.1; qcov=1.01; evalue=1.77e-146; confidence=high
Rice	`Os04g0609300` - identity=43.1; qcov=1.02; evalue=2.46e-102; confidence=medium
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057768032.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768032.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057768032.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768032.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48082522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B103,B40,C42,D10
`Chr1:48082531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B126,C6,C63,C67
`Chr1:48082567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57
`Chr1:48082705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B103,B40,C42,D10
`Chr1:48082756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B138,C83,C86
`Chr1:48082763`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr1:48082763`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr1:48082862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:48082889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:48082895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B124,B134,B87
`Chr1:48083051`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	115	A11,A13,A14,A15,A2,A23,A25,A3,A4,A6,A8,B10,B100,B104,B105,B108,B11,B111,B117,B119,B12,B121,B122,B123,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B135,B137,B138,B14,B15,B18,B19,B2,B24,B27,B30,B32,B33,B34,B38,B39,B40,B42,B43,B46,B48,B5,B52,B55,B57,B6,B63,B65,B66,B67,B69,B70,B77,B8,B81,B82,B84,B85,B9,B91,B93,B94,B98,C12,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C21,C23,C25,C26,C29,C31,C34,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C47,C53,C54,C57,C58,C59,C61,C64,C66,C70,C71,C74,C77,C78,C8,C80,C83,C85,C86,D11,D2,D4
`Chr1:48083063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768032.1

445 aa

222

445

Transferase

PF02458 Transferase 7-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768032.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	7	428	9.6e-98	328.4	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912049.1
AAATAATTAAAAAATGTGTATAAAATTTAGAACGAGGCCATCAAAATTAAGCGGAGAAAAGGACTCATCAAATTTAATGTGTTAAATGGTTGGATATTTTATAAATATTGAATATGAATGTGGTTTAAAATACAAATAATGGATAGTTTCCGAAAAAGGAAATTCTACAATTATTAATGTTAAAGGAAGGTTTTTATTTTATCACATATAATCCTTATTCTATGTTACTATATATATGAGCATGTATGGCTAGCTCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988250
ATGGACTCCGGCGCTTTTCCGGTGACAATCAAGCGGAGAGAGGTGGTGGCCGCGGTGCTACCGGTGCAGGAGCACTGGCTGCCGATGTCCAACCTCGACTTGCTCCTGCCGCCCCTACACTTCGGAATCTTCTTTTGTTACAAGAATATCGAAAGGGTGTCGCCGGAAAGCATGGCGGCGGTGCTCAAGAAATCCCTAGCCCAGGTGCTGGTTTACTTCGCCCCCTTCGCCGGAGAGATCGTGGCCAACGGCCAAGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768032.1
MDSGAFPVTIKRREVVAAVLPVQEHWLPMSNLDLLLPPLHFGIFFCYKNIERVSPESMAAVLKKSLAQVLVYFAPFAGEIVANGQGEPEILCNNRGVDFTHAYADVELKHIDFYKPDLSLHAKLVPLHMHALLTVQVTDLKCGGLFIGCTFDHRAADAHSANMFLTAWADIARSNPIKLLPSFRRSLFNPRRPPQPHKSLDELYAPLLQPPTAGNHCLLTSRIYYVQSDEIDRLQSQSSHKGTRKSKIESFSAFLWQTLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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