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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000708`

染色体: Chr06 坐标: 6372308-6373431 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000708`
名称	SmilChr06G000708
描述	auxin-induced protein IAA6-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6372308 - 6373431 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988259`
GeneID	`130988259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988259`
原始查询	`LOC130988259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-induced protein IAA6-like
产物	auxin-induced protein IAA6-like
Arabidopsis	`AT4G28640` (IAA11) indole-3-acetic acid inducible 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828982] identity=32.7; qcov=0.789; evalue=8.56e-20; confidence=low
Rice	`Os05g0230700` (OsIAA17) - identity=33.8; qcov=0.686; evalue=1.94e-21; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768045.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768045.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768045.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768045.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6372387`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A19,A2,B11,B111,B124,B134,B137,B18,B2,B24,B26,B32,B34,B4,B41,B45,B59,B7,B82,B86,B89,B9,C14,C25,C30,C50,C54,C55,C60,C71,C82,C87,C9,D2
`Chr6:6372391`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B2,B85,C63,C64,C66,D11
`Chr6:6372485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:6372534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B82,C60
`Chr6:6372664`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr6:6372664`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr6:6372666`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr6:6372666`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr6:6372671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B37,B61,B74
`Chr6:6372726`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A19,B23,B85,B9,B95,C50,C71,C87,D2
`Chr6:6372728`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A19,B23,B85,B9,B95,C50,C71,C87,D2
`Chr6:6372783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B137,B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768045.1

194 aa

194

AUX_IAA

PF02309 AUX_IAA 61-149 aa PF02309 AUX_IAA 155-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768045.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	61	149	8.1e-29	101.7	AUX/IAA family
`XP_057768045.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	155	190	8.1e-29	101.7	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912062.1
CGGCATTTGGGTCGGCCAAAAGTCTGGCATTGATGCTGACATCCTTGCTGCCCACTCCAATATATATATCCACACCCACACCCCATATCCGTCTCACCTTTCTTTCTTCACTCTTGGTGGAAATGGAGGATATGGAGCTCCGATTGGAACTCTCACTTTCAACCCGACCCGACCCGCCCTCCAACAGAAAACGCGCTTTTGCTCACACCCATTCGCCCTTCTCCAACAGAAACGGTGGATCTGTGGTTGGTTGGCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988259
ATGCTGACATCCTTGCTGCCCACTCCAATATATATATCCACACCCACACCCCATATCCGTCTCACCTTTCTTTCTTCACTCTTGGTGGAAATGGAGGATATGGAGCTCCGATTGGAACTCTCACTTTCAACCCGACCCGACCCGCCCTCCAACAGAAAACGCGCTTTTGCTCACACCCATTCGCCCTTCTCCAACAGAAACGGTGGATCTGTGGTTGGTTGGCCGCCGGTGAGGTCTTGGAGGAAGCAGCTGTGTCACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768045.1
MLTSLLPTPIYISTPTPHIRLTFLSSLLVEMEDMELRLELSLSTRPDPPSNRKRAFAHTHSPFSNRNGGSVVGWPPVRSWRKQLCHRNRRVCATNYVNVENGGGGGWRAANSVYVKVKMEGVGITRKIDLSFHRSHRTLATNLIDLFGKSEENVAYKLMYQNKEDEWLQAGDVPWECFIKSARRLKLEKNGNSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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